21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2013 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2013  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  272  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.145779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4031  PilT protein-like  55.32 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2230  hypothetical protein  52.94 
 
 		 136 aa  124  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2015  hypothetical protein  53.24 
 
 		 140 aa  103  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2989  PilT domain-containing protein  39.68 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00342264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2147  hypothetical protein  34.68 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.580506  normal  0.267896 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1961  PilT domain-containing protein  29.31 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.249372  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1646  hypothetical protein  32.37 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5449  hypothetical protein  36.69 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10593  hypothetical protein  31.11 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3892  hypothetical protein  40.62 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.678557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0789  PilT protein domain protein  30.4 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1954  PilT protein domain protein  35.25 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1570  hypothetical protein  31.71 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.652312  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2128  PilT domain-containing protein  30.83 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0770  hypothetical protein  25.93 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.468965  normal  0.046742 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4271  hypothetical protein  28.91 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2122  PilT domain-containing protein  26.09 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0497789  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1768  hypothetical protein  27.27 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1898  nucleic acid-binding protein contains PIN domain-like protein  25 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1872  hypothetical protein  25 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>