14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1961 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1961  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  282  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.249372  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1570  hypothetical protein  37.23 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.652312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1646  hypothetical protein  39.68 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2147  hypothetical protein  37.78 
 
 		 136 aa  97.4  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.580506  normal  0.267896 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0789  PilT protein domain protein  34.35 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0770  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.468965  normal  0.046742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2013  hypothetical protein  29.31 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.145779 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2989  PilT domain-containing protein  27.35 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00342264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4031  PilT protein-like  31.45 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2230  hypothetical protein  27.59 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2111  hypothetical protein  25.98 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1954  PilT protein domain protein  24.29 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2650  hypothetical protein  29.77 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722874  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5449  hypothetical protein  28.05 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>