16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2650 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2650  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  288  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722874  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1872  hypothetical protein  40.88 
 
 		 134 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1898  nucleic acid-binding protein contains PIN domain-like protein  40.88 
 
 		 134 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0094  hypothetical protein  40.91 
 
 		 135 aa  97.1  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167961  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1361  hypothetical protein  32.35 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.324821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2105  PilT protein domain protein  33.1 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.349104 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4668  hypothetical protein  29.1 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264149 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1768  hypothetical protein  29.32 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0415  PilT domain-containing protein  30.53 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00369357  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2111  hypothetical protein  27.91 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2122  PilT domain-containing protein  28.57 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0497789  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1961  PilT domain-containing protein  29.77 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.249372  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2128  PilT domain-containing protein  27.82 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0688  PilT protein-like  27.48 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000301762  unclonable  0.00000000741036 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3164  PilT domain-containing protein  23.7 
 
 		 133 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.702084  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12570  hypothetical protein  28.68 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0730872  normal  0.131277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>