14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0094 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0094  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  280  7.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167961  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1872  hypothetical protein  40.46 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1898  nucleic acid-binding protein contains PIN domain-like protein  40.46 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2650  hypothetical protein  40.91 
 
 		 140 aa  97.1  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722874  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1361  hypothetical protein  36.76 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.324821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2105  PilT protein domain protein  40 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.349104 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4668  hypothetical protein  30.47 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264149 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0415  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00369357  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2122  PilT domain-containing protein  32.56 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0497789  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1768  hypothetical protein  30.77 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0525  hypothetical protein  32.2 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12570  hypothetical protein  31.78 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0730872  normal  0.131277 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0688  PilT protein-like  27.78 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000301762  unclonable  0.00000000741036 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2473  PilT protein domain protein  25.6 
 
 		 144 aa  40  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>