18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1872 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1898  nucleic acid-binding protein contains PIN domain-like protein  100 
 
 
134 aa  276  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1872  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  276  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0094  hypothetical protein  40.46 
 
 
135 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2650  hypothetical protein  40.88 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722874  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1361  hypothetical protein  34.07 
 
 
141 aa  89  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.324821  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4668  hypothetical protein  34.88 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264149 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1768  hypothetical protein  32.58 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654349  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2105  PilT protein domain protein  30.53 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.349104 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0415  PilT domain-containing protein  31.54 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00369357  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2122  PilT domain-containing protein  29.23 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0497789  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0688  PilT protein-like  29.71 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000301762  unclonable  0.00000000741036 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12570  hypothetical protein  30.71 
 
 
131 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0730872  normal  0.131277 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0525  hypothetical protein  27.73 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2128  PilT domain-containing protein  25.19 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1623  PilT domain-containing protein  28.12 
 
 
106 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.266052  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3164  PilT domain-containing protein  25.9 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.702084  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2013  hypothetical protein  25 
 
 
138 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.145779 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2111  hypothetical protein  23.81 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>