15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3164 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3164  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 133 aa  269  8.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.702084  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0415  PilT domain-containing protein  48.87 
 
 		 141 aa  144  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00369357  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1623  PilT domain-containing protein  43.69 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.266052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1768  hypothetical protein  32.33 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12570  hypothetical protein  32.28 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0730872  normal  0.131277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2105  PilT protein domain protein  31.62 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.349104 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0688  PilT protein-like  25 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000301762  unclonable  0.00000000741036 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2128  PilT domain-containing protein  30 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1361  hypothetical protein  26.87 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.324821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0525  hypothetical protein  32.23 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2122  PilT domain-containing protein  28.68 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0497789  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4668  hypothetical protein  25 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264149 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1872  hypothetical protein  25.9 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1898  nucleic acid-binding protein contains PIN domain-like protein  25.9 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2650  hypothetical protein  23.7 
 
 		 140 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>