14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4668 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4668  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  281  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264149 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1872  hypothetical protein  34.88 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1898  nucleic acid-binding protein contains PIN domain-like protein  34.88 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1361  hypothetical protein  35.88 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.324821  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0094  hypothetical protein  30.47 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167961  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2105  PilT protein domain protein  28.99 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.349104 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2650  hypothetical protein  29.1 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1768  hypothetical protein  28.57 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654349  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2122  PilT domain-containing protein  27.74 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0497789  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0525  hypothetical protein  32.77 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12570  hypothetical protein  26.36 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0730872  normal  0.131277 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2377  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like region  27.64 
 
 
164 aa  45.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000258071  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3164  PilT domain-containing protein  25 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.702084  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0415  PilT domain-containing protein  25 
 
 
141 aa  43.5  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00369357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>