19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2128 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2128  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 132 aa  271  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0688  PilT protein-like  59.38 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000301762  unclonable  0.00000000741036 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1768  hypothetical protein  32.84 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2122  PilT domain-containing protein  35.07 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0497789  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0415  PilT domain-containing protein  33.08 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00369357  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2105  PilT protein domain protein  28.99 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.349104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12570  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0730872  normal  0.131277 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3164  PilT domain-containing protein  30 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.702084  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1496  PilT protein domain protein  27.56 
 
 		 142 aa  50.8  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.296648  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10593  hypothetical protein  26.89 
 
 		 135 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2013  hypothetical protein  30.83 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.145779 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1872  hypothetical protein  25.19 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1898  nucleic acid-binding protein contains PIN domain-like protein  25.19 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2650  hypothetical protein  27.82 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722874  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2230  hypothetical protein  26.89 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1361  hypothetical protein  25 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.324821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2111  hypothetical protein  24.82 
 
 		 137 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0829  hypothetical protein  28.68 
 
 		 153 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1552  PilT protein domain protein  25.74 
 
 		 151 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>