15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1496 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1496  PilT protein domain protein  100 
 
 		 142 aa  280  4.0000000000000003e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.296648  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2473  PilT protein domain protein  53.52 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3244  PilT protein domain protein  53.52 
 
 		 144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5216  normal  0.257013 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3193  PilT protein domain protein  54.23 
 
 		 144 aa  127  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1709  PilT protein domain protein  48.23 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10072 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1552  PilT protein domain protein  31.75 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2128  PilT domain-containing protein  27.56 
 
 		 132 aa  50.8  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0688  PilT protein-like  25.2 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000301762  unclonable  0.00000000741036 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2122  PilT domain-containing protein  31.62 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0497789  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1082  hypothetical protein  27.66 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461087 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1768  hypothetical protein  27.13 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0829  hypothetical protein  30.4 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12570  hypothetical protein  31.75 
 
 		 131 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0730872  normal  0.131277 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0415  PilT domain-containing protein  26.4 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00369357  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1461  PilT-like protein  30.07 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>