19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2105 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2105  PilT protein domain protein  100 
 
 
138 aa  287  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.349104 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2122  PilT domain-containing protein  39.86 
 
 
142 aa  92  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0497789  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0094  hypothetical protein  40 
 
 
135 aa  77  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167961  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0415  PilT domain-containing protein  35.97 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00369357  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1768  hypothetical protein  34.53 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654349  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0688  PilT protein-like  33.33 
 
 
132 aa  72  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000301762  unclonable  0.00000000741036 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2650  hypothetical protein  33.1 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722874  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4668  hypothetical protein  28.99 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264149 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12570  hypothetical protein  33.09 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0730872  normal  0.131277 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1898  nucleic acid-binding protein contains PIN domain-like protein  30.53 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1872  hypothetical protein  30.53 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1361  hypothetical protein  30.08 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.324821  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2128  PilT domain-containing protein  28.99 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3164  PilT domain-containing protein  31.62 
 
 
133 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.702084  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0829  hypothetical protein  31.69 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2111  hypothetical protein  30.43 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0525  hypothetical protein  32.52 
 
 
157 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1552  PilT protein domain protein  26.43 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1623  PilT domain-containing protein  26.67 
 
 
106 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.266052  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>