14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0789 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0789  PilT protein domain protein  100 
 
 		 145 aa  294  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1961  PilT domain-containing protein  34.35 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.249372  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1646  hypothetical protein  34.85 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2147  hypothetical protein  36.07 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.580506  normal  0.267896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1570  hypothetical protein  32.06 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.652312  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2989  PilT domain-containing protein  31.03 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00342264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0770  hypothetical protein  32.35 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.468965  normal  0.046742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2013  hypothetical protein  30.4 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.145779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4031  PilT protein-like  30.99 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1954  PilT protein domain protein  27.41 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2015  hypothetical protein  32.56 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2230  hypothetical protein  28.21 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2111  hypothetical protein  26.61 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10593  hypothetical protein  24.14 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0155469  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>