14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2989 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2989  PilT domain-containing protein  100 
 
 
135 aa  267  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00342264  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2013  hypothetical protein  39.68 
 
 
138 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.145779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2230  hypothetical protein  45.16 
 
 
136 aa  89.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10593  hypothetical protein  30.33 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0155469  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4031  PilT protein-like  38.52 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1961  PilT domain-containing protein  27.35 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.249372  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0789  PilT protein domain protein  31.03 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2147  hypothetical protein  27.27 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.580506  normal  0.267896 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0770  hypothetical protein  32.17 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.468965  normal  0.046742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5449  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1646  hypothetical protein  30.77 
 
 
138 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3892  hypothetical protein  34.62 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.678557  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1570  hypothetical protein  29.31 
 
 
138 aa  51.2  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.652312  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2015  hypothetical protein  31.75 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.219213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>