18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4031 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4031  PilT protein-like  100 
 
 		 142 aa  280  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2013  hypothetical protein  55.32 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.145779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2230  hypothetical protein  47.1 
 
 		 136 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2147  hypothetical protein  33.06 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.580506  normal  0.267896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2015  hypothetical protein  41.84 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2989  PilT domain-containing protein  38.52 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00342264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1646  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1961  PilT domain-containing protein  31.45 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.249372  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10593  hypothetical protein  32.12 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0789  PilT protein domain protein  30.99 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3892  hypothetical protein  44.32 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.678557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5449  hypothetical protein  36.17 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0770  hypothetical protein  29.71 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.468965  normal  0.046742 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1954  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1496  PilT protein domain protein  34.35 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.296648  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1570  hypothetical protein  27.97 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.652312  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2128  PilT domain-containing protein  28.1 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0688  PilT protein-like  27.43 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000301762  unclonable  0.00000000741036 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>