More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2131 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2131  SSU ribosomal protein S15P  100 
 
 
89 aa  173  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  79.78 
 
 
89 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  79.78 
 
 
89 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  76.4 
 
 
89 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  76.4 
 
 
89 aa  137  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 
89 aa  137  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  75.28 
 
 
89 aa  136  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  71.91 
 
 
100 aa  135  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  76.4 
 
 
91 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  77.53 
 
 
89 aa  134  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  74.16 
 
 
89 aa  134  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  76.4 
 
 
89 aa  133  9e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 
89 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  73.03 
 
 
89 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  72.73 
 
 
90 aa  130  7.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 
89 aa  127  6e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 
89 aa  122  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  61.8 
 
 
89 aa  120  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  118  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  118  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  62.92 
 
 
89 aa  118  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  61.36 
 
 
90 aa  117  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 
88 aa  116  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  116  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  116  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2220  ribosomal protein S15  70.79 
 
 
89 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000029648  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  68.29 
 
 
88 aa  116  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  62.92 
 
 
89 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0073  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 
88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 
88 aa  114  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  114  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 
87 aa  114  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 
87 aa  114  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  113  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0079  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 
88 aa  113  7.999999999999999e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  66.28 
 
 
88 aa  113  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 
88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  65.12 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  59.55 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4028  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776688  normal  0.268185 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0921  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4397  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.854765  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  59.55 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2033  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 
90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  111  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0177  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  111  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  111  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0964  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  111  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0254424  normal  0.0332501 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
88 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>