158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3229 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3229  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
198 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3519  glutathione S-transferase domain-containing protein  88.83 
 
 
198 aa  371  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3349  glutathione S-transferase domain-containing protein  87.82 
 
 
198 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0604  glutathione S-transferase domain-containing protein  88.32 
 
 
198 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0746  glutathione S-transferase family protein  84.85 
 
 
198 aa  359  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0810  glutathione S-transferase domain-containing protein  81.82 
 
 
198 aa  353  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3637  Glutathione S-transferase domain protein  81.82 
 
 
198 aa  353  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.455595 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3695  glutathione S-transferase domain-containing protein  81.82 
 
 
198 aa  353  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0042182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3819  glutathione S-transferase domain-containing protein  81.82 
 
 
198 aa  352  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.538317 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0664  glutathione S-transferase family protein  61.93 
 
 
200 aa  264  5.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0473248  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0859  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.6 
 
 
199 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0994  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.87 
 
 
198 aa  238  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317376 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0944  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.84 
 
 
197 aa  235  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.148191  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1878  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.31 
 
 
200 aa  127  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.277157 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3681  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.87 
 
 
200 aa  119  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1322  glutathione S-transferase-like protein  34.67 
 
 
196 aa  115  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0363606  normal  0.491489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1545  glutathione S-transferase domain-containing protein  35 
 
 
201 aa  111  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0116241 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2111  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.18 
 
 
199 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3449  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.5 
 
 
203 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3758  Glutathione S-transferase domain  32 
 
 
203 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  31.53 
 
 
202 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3647  Glutathione S-transferase domain  32.5 
 
 
203 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0997379 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  30.54 
 
 
202 aa  101  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  31.03 
 
 
202 aa  101  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  31.53 
 
 
202 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2815  glutathione S-transferase-like  31.68 
 
 
200 aa  99  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.370194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  31.86 
 
 
204 aa  98.6  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.7 
 
 
202 aa  97.8  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0226  glutathione S-transferase domain-containing protein  31 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.7 
 
 
204 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.56 
 
 
204 aa  96.3  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.7 
 
 
203 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3206  glutathione S-transferase, putative  29.65 
 
 
205 aa  94.7  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3271  glutathione S-transferase family protein  33 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4727  glutathione S-transferase, putative  29.47 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.981894  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0322  glutathione S-transferase-like  30.58 
 
 
204 aa  92.8  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.672766 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  29.76 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.76 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.76 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7162  Glutathione S-transferase domain protein  30 
 
 
200 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6331  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 
200 aa  92  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  hitchhiker  0.00751047 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4235  glutathione S-transferase-like protein  33.69 
 
 
205 aa  91.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1206  putative glutathione S-transferase  30.94 
 
 
204 aa  91.3  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06120  hypothetical protein  31.16 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352199  decreased coverage  0.0055796 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2361  glutathione S-transferase  28.57 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3398  glutathione S-transferase  28.57 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  28.08 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2116  glutathione S-transferase-like protein  32.35 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489753  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4086  glutathione S-transferase-like  29.27 
 
 
205 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1835  Glutathione S-transferase domain protein  33.5 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0276  glutathione S-transferase  28.57 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1137  glutathione S-transferase  28.57 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3356  glutathione S-transferase family protein  28.57 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3392  glutathione S-transferase family protein  28.57 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2542  glutathione S-transferase  28.57 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4668  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.47 
 
 
204 aa  89.7  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2242  glutathione S-transferase-like protein  29.56 
 
 
202 aa  88.6  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.025244  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0363  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.99 
 
 
207 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115928 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6155  Glutathione S-transferase domain protein  32.18 
 
 
205 aa  88.2  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3279  putative glutathione S-transferase family protein  32.2 
 
 
203 aa  87.8  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0448  glutathione S-transferase, putative  27.72 
 
 
204 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  29.52 
 
 
202 aa  87.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3883  Glutathione S-transferase domain protein  32.97 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5192  glutathione S-transferase-like protein  28.22 
 
 
221 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355066  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4913  Glutathione S-transferase domain  29.9 
 
 
205 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.413564  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0572  hypothetical protein  29.65 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.29 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4868  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.71 
 
 
207 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895586  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  28.71 
 
 
206 aa  85.5  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0064  glutathione S-transferase  29.85 
 
 
202 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.876217  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2804  glutathione S-transferase-like protein  30.69 
 
 
202 aa  85.5  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.515361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  29.21 
 
 
204 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0171  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.03 
 
 
200 aa  85.1  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0335  glutathione S-transferase family protein  29.19 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  30.2 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2167  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.98 
 
 
199 aa  84  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.366461  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  28.29 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1346  glutathione S-transferase-like  29.85 
 
 
204 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.462561  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3228  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.864486  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0360  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.19 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215038  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1397  glutathione S-transferase  29.35 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1512  Glutathione S-transferase domain  26.73 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0319  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.71 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5166  Glutathione S-transferase domain protein  27.88 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3535  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.73 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0785  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.12 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.238617  normal  0.0753849 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5879  Glutathione S-transferase domain protein  29.65 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2957  glutathione S-transferase-like protein  29.7 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1795  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.54 
 
 
221 aa  77.8  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2181  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.86 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.77 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  27.67 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3375  Glutathione S-transferase domain protein  28.77 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  26.96 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3713  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.9 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3913  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.8 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0846475  normal  0.026606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0851  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.88 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.451549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2729  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.14 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1562  glutathione S-transferase related protein  28.8 
 
 
198 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.572147  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2512  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.09 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>