222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3206 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3206  glutathione S-transferase, putative  100 
 
 		 205 aa  429  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1878  glutathione S-transferase domain-containing protein  34 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277157 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3271  glutathione S-transferase family protein  35.12 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2111  glutathione S-transferase domain-containing protein  35 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1545  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.58 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0116241 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2804  glutathione S-transferase-like protein  34.65 
 
 		 202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.515361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1397  glutathione S-transferase  35.78 
 
 		 202 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0064  glutathione S-transferase  35.78 
 
 		 202 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.876217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3681  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 200 aa  108  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0322  glutathione S-transferase-like  32.85 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.672766 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3758  Glutathione S-transferase domain  33.99 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2815  glutathione S-transferase-like  33 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.370194 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3819  glutathione S-transferase domain-containing protein  31 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.538317 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3637  Glutathione S-transferase domain protein  31 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.455595 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3695  glutathione S-transferase domain-containing protein  31 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0042182  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0810  glutathione S-transferase domain-containing protein  31 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0171  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.5 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7162  Glutathione S-transferase domain protein  33.83 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6331  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.83 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  hitchhiker  0.00751047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3449  glutathione S-transferase domain-containing protein  33 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3279  putative glutathione S-transferase family protein  32.52 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3349  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.65 
 
 		 198 aa  101  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0604  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.65 
 
 		 198 aa  101  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3519  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.65 
 
 		 198 aa  101  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0363  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3647  Glutathione S-transferase domain  33.5 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0997379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  31.34 
 
 		 202 aa  99.4  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.54 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0746  glutathione S-transferase family protein  30 
 
 		 198 aa  99.4  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  32.68 
 
 		 202 aa  98.6  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5192  glutathione S-transferase-like protein  31.1 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355066  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.54 
 
 		 203 aa  98.2  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0335  glutathione S-transferase family protein  33.82 
 
 		 207 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0994  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317376 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.58 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0664  glutathione S-transferase family protein  29.65 
 
 		 200 aa  96.7  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0473248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0448  glutathione S-transferase, putative  32.85 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0944  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.03 
 
 		 197 aa  95.9  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.148191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0360  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 		 207 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215038  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4727  glutathione S-transferase, putative  30.29 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.981894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2242  glutathione S-transferase-like protein  31.68 
 
 		 202 aa  95.1  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.025244  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1590  Glutathione S-transferase domain protein  32.45 
 
 		 198 aa  95.1  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806366 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3229  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.65 
 
 		 198 aa  94.7  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  32.37 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1322  glutathione S-transferase-like protein  33.17 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0363606  normal  0.491489 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.37 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.37 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  32.35 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1835  Glutathione S-transferase domain protein  31.71 
 
 		 203 aa  93.2  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4868  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.68 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895586  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2167  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.91 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.366461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06120  hypothetical protein  31.61 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352199  decreased coverage  0.0055796 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.12 
 
 		 202 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2361  glutathione S-transferase  29.81 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  30.29 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3883  Glutathione S-transferase domain protein  30.39 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2542  glutathione S-transferase  29.81 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3392  glutathione S-transferase family protein  29.81 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1137  glutathione S-transferase  29.81 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3356  glutathione S-transferase family protein  29.81 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0572  hypothetical protein  31.61 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3398  glutathione S-transferase  29.81 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  30.29 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0276  glutathione S-transferase  29.81 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  31.53 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0859  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.35 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2729  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 227 aa  85.5  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  31.28 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4913  Glutathione S-transferase domain  28.71 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.413564  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  33.01 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3913  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.38 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0846475  normal  0.026606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  29.86 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0226  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.39 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4235  glutathione S-transferase-like protein  30.77 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  29.86 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4086  glutathione S-transferase-like  30.98 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0851  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.85 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451549 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  30.93 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2181  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.82 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  28.78 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3535  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.37 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2957  glutathione S-transferase-like protein  31.03 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.19 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  27.7 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1935  glutathione S-transferase-like protein  31.09 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00060998  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3228  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.69 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.864486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0785  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.1 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.238617  normal  0.0753849 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4668  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.5 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.5 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6155  Glutathione S-transferase domain protein  28.64 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0089  putative glutathione S-transferase  30.69 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3375  Glutathione S-transferase domain protein  28.5 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0319  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.29 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0702  glutathione S-transferase family protein  28.8 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5166  Glutathione S-transferase domain protein  28.06 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4324  Glutathione S-transferase domain protein  27.18 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0693  glutathione S-transferase family protein  28.8 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0116  Glutathione S-transferase domain protein  28.36 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0121  putative glutathione S-transferase  28.36 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0139  putative glutathione S-transferase  28.29 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>