165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0944 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0944  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 197 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.148191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0994  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.51 
 
 		 198 aa  285  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317376 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3819  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.36 
 
 		 198 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.538317 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3637  Glutathione S-transferase domain protein  56.85 
 
 		 198 aa  236  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.455595 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0810  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.85 
 
 		 198 aa  236  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3695  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.85 
 
 		 198 aa  236  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0042182  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0859  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.87 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3229  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.84 
 
 		 198 aa  235  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3519  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.05 
 
 		 198 aa  234  9e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0604  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.05 
 
 		 198 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3349  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.05 
 
 		 198 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0664  glutathione S-transferase family protein  54.31 
 
 		 200 aa  229  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0473248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0746  glutathione S-transferase family protein  53.81 
 
 		 198 aa  228  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1322  glutathione S-transferase-like protein  36.55 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0363606  normal  0.491489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1545  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.11 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0116241 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3681  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.55 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1878  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.85 
 
 		 200 aa  127  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277157 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3449  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.24 
 
 		 203 aa  118  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3758  Glutathione S-transferase domain  36 
 
 		 203 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2815  glutathione S-transferase-like  36.27 
 
 		 200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.370194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3647  Glutathione S-transferase domain  38.16 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0997379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7162  Glutathione S-transferase domain protein  34.33 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2111  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.19 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4727  glutathione S-transferase, putative  35.96 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.981894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6331  glutathione S-transferase domain-containing protein  34 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  hitchhiker  0.00751047 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  35.96 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5192  glutathione S-transferase-like protein  33.66 
 
 		 221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355066  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0363  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.15 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115928 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0448  glutathione S-transferase, putative  33.82 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06120  hypothetical protein  35.18 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352199  decreased coverage  0.0055796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0572  hypothetical protein  35.68 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4868  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895586  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4086  glutathione S-transferase-like  33.98 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3271  glutathione S-transferase family protein  36.32 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4235  glutathione S-transferase-like protein  35.79 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1835  Glutathione S-transferase domain protein  35.32 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0360  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215038  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0335  glutathione S-transferase family protein  33.66 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4913  Glutathione S-transferase domain  33.82 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.413564  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.92 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  34.31 
 
 		 202 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.63 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0226  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.5 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  34.31 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3279  putative glutathione S-transferase family protein  33.82 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.34 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.63 
 
 		 203 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1397  glutathione S-transferase  34.16 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1346  glutathione S-transferase-like  34.33 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.462561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0064  glutathione S-transferase  34.16 
 
 		 202 aa  99.8  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.876217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2804  glutathione S-transferase-like protein  34.16 
 
 		 202 aa  99.8  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.515361 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0319  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.55 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4668  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.95 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1206  putative glutathione S-transferase  35.11 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  32.51 
 
 		 204 aa  98.2  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.43 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.14 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  35.14 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.14 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2167  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.16 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.366461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3206  glutathione S-transferase, putative  31.03 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  35.83 
 
 		 203 aa  94.4  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2361  glutathione S-transferase  33.66 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3398  glutathione S-transferase  33.66 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0276  glutathione S-transferase  33.66 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1137  glutathione S-transferase  33.66 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3356  glutathione S-transferase family protein  33.66 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3392  glutathione S-transferase family protein  33.66 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2542  glutathione S-transferase  33.66 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  31.71 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  30.73 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2242  glutathione S-transferase-like protein  30.58 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.025244  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0322  glutathione S-transferase-like  33.33 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.672766 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.24 
 
 		 204 aa  92  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3375  Glutathione S-transferase domain protein  30.24 
 
 		 204 aa  92  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0171  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.32 
 
 		 200 aa  91.7  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3713  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.05 
 
 		 213 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6155  Glutathione S-transferase domain protein  31.22 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3883  Glutathione S-transferase domain protein  32.51 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  31.07 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3228  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.5 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.864486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  31.4 
 
 		 202 aa  88.6  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2116  glutathione S-transferase-like protein  30.58 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5879  Glutathione S-transferase domain protein  29.9 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2957  glutathione S-transferase-like protein  30.05 
 
 		 204 aa  87  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5166  Glutathione S-transferase domain protein  29.52 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1512  Glutathione S-transferase domain  30.92 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3913  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.09 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0846475  normal  0.026606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2181  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.05 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0785  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.98 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.238617  normal  0.0753849 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  28.57 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  28.1 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4324  Glutathione S-transferase domain protein  28.28 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1795  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.79 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  30.05 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  29.21 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2729  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.96 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3535  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.71 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1089  Glutathione S-transferase domain  29.65 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.600559  hitchhiker  0.000151531 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1910  glutathione S-transferase family protein  30.85 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>