153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0835 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01706  N,N'-diacetylchitobiose-specific enzyme IIC component of PTS  80.79 
 
 
452 aa  762    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1905  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  80.79 
 
 
452 aa  762    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0104161  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01694  hypothetical protein  80.79 
 
 
452 aa  762    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1707  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  82.56 
 
 
452 aa  758    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1092  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  85.21 
 
 
453 aa  780    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0153711  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1819  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  80.79 
 
 
452 aa  762    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.687565  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1958  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  80.79 
 
 
452 aa  762    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0835  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  100 
 
 
453 aa  902    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098923 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3569  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  85.21 
 
 
453 aa  780    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000103211  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1145  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  85.21 
 
 
453 aa  780    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1895  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  80.57 
 
 
452 aa  759    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.677807  normal  0.163487 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1454  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  80.79 
 
 
452 aa  762    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.262654 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1427  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  81.68 
 
 
452 aa  762    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.428261  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1442  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  81.9 
 
 
452 aa  764    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1410  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  81.68 
 
 
452 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470901  normal  0.0748148 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1858  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  81.68 
 
 
452 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.98931  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2031  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  81.68 
 
 
452 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2455  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  81.02 
 
 
452 aa  764    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.7631  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1979  N,N'-diacetylchitobiose permease IIC component  74.41 
 
 
253 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.367022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5330  PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.52 
 
 
435 aa  264  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3753  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  33.04 
 
 
435 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5320  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.86 
 
 
435 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5299  PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.14 
 
 
434 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000370618 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5629  PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.08 
 
 
434 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000203368 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5003  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  32.96 
 
 
435 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5058  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  32.74 
 
 
435 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5443  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  32.74 
 
 
435 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5375  PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.04 
 
 
435 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4888  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.64 
 
 
434 aa  249  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4903  PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.52 
 
 
435 aa  249  6e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1738  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  35.17 
 
 
437 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1634  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  34.94 
 
 
440 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0199  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  35.98 
 
 
439 aa  247  3e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1619  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  34.39 
 
 
437 aa  244  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.711166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2668  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  32.9 
 
 
438 aa  229  8e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5063  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  32.32 
 
 
433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5448  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  32.32 
 
 
433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4908  PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.1 
 
 
433 aa  220  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5304  PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.1 
 
 
433 aa  220  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000552598 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5335  PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.32 
 
 
433 aa  219  7e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5624  PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.1 
 
 
433 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000179415 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4895  PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.1 
 
 
433 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5382  PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.1 
 
 
433 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5006  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  31.5 
 
 
433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2981  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  32.97 
 
 
439 aa  213  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299528  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3346  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  32.11 
 
 
440 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2601  putative cellobiose phosphotransferase enzyme IIC component  31.95 
 
 
450 aa  209  6e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5325  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.4 
 
 
433 aa  208  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2135  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  32.83 
 
 
451 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2496  PTS system, cellobiose-specific IIC component, putative  29.93 
 
 
427 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0934011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2559  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  29.93 
 
 
427 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.235494  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2418  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  29.71 
 
 
427 aa  202  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2912  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  29.93 
 
 
427 aa  200  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.813748 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2270  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  29.56 
 
 
427 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2254  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIC component  30.38 
 
 
427 aa  199  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.716734  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0181  cellobiose-specific PTS system IIC component  29.15 
 
 
494 aa  199  7e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.113932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2480  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.38 
 
 
427 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2291  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  30.75 
 
 
428 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2463  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  30.75 
 
 
428 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2212  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIC component  30.16 
 
 
427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0262  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  33.03 
 
 
428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0846  PTS system, cellobiose-specific IIC component  29.49 
 
 
436 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0689  PTS system, cellobiose-specific IIC component  29.49 
 
 
436 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03624  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.29 
 
 
447 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4490  PTS system, cellobiose-specific IIC component  29.06 
 
 
436 aa  195  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000107554 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3200  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  31.56 
 
 
441 aa  194  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0704  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  28.85 
 
 
436 aa  194  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0955  PTS system, cellobiose-specific IIC component  29.06 
 
 
436 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0884  PTS system, cellobiose-specific IIC component  29.06 
 
 
436 aa  193  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0754  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  29.06 
 
 
436 aa  193  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.461511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0702  PTS system, cellobiose-specific IIC component  29.06 
 
 
436 aa  193  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0793  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  29.06 
 
 
436 aa  193  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002436  PTS system cellobiose-specific IIC component  30.42 
 
 
444 aa  190  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1790  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  29.35 
 
 
427 aa  189  8e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3282  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  30.67 
 
 
445 aa  189  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.171389  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1858  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  31.36 
 
 
453 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0195  cellobiose-specific PTS system IIC component  28.48 
 
 
476 aa  188  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0622401  normal  0.284293 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0330  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.93 
 
 
433 aa  187  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.240964  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0736  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  29.82 
 
 
448 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2139  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  27.39 
 
 
451 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00121046  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0009  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  31.79 
 
 
437 aa  182  9.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0010  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  30.46 
 
 
437 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0672  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  29.39 
 
 
434 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0343  cellobiose-specific PTS system IIC component  30.16 
 
 
433 aa  180  5.999999999999999e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000855206  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0034  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  29.02 
 
 
438 aa  178  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2996  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  29.53 
 
 
433 aa  178  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00652008  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0029  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  29.02 
 
 
440 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0468  cellobiose-specific PTS system IIC component  28.1 
 
 
445 aa  177  3e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00462633  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0901  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.72 
 
 
446 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0703  PTS system, cellobiose permease IIC component  34.06 
 
 
428 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236123  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3121  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  29.82 
 
 
429 aa  177  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0071332  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3870  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  27.15 
 
 
420 aa  177  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.448172  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4223  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  31.7 
 
 
439 aa  176  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298661  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2306  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  28.29 
 
 
437 aa  176  8e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000207332  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3469  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  29.2 
 
 
445 aa  176  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.868513  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2107  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  28.13 
 
 
442 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1256  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  30.53 
 
 
428 aa  172  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0756  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  29.72 
 
 
446 aa  172  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0570  cellobiose-specific PTS system IIC component  28.35 
 
 
443 aa  170  4e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.976789  normal  0.163994 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1823  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  27 
 
 
442 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.312785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>