More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1272 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1272  ribosomal protein S14  100 
 
 		 95 aa  194  3e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3982  ribosomal protein S14  78.95 
 
 		 95 aa  158  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5057  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 		 101 aa  107  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0176804  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0488  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000639761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2822  ribosomal protein S14  52 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00224384 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05785  ribosomal protein S14  53.68 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0333  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 		 101 aa  104  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000766053  hitchhiker  0.000426271 
 
 
-
 
NC_002950  PG1925  30S ribosomal protein S14  54.74 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0184  30S ribosomal protein S14  52.63 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.282468 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0384  30S ribosomal protein S14  54.74 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0434  SSU ribosomal protein S14P  52.48 
 
 		 101 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0108067  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0439  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  103  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000050629  hitchhiker  0.0000949985 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1160  30S ribosomal protein S14  53.68 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204573  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0502  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000100367  hitchhiker  0.00403438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0497  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000674394  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0308  ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  101  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000208826  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4356  ribosomal protein S14  51.58 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629115  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3270  30S ribosomal protein S14  52 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0411187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2312  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00369177  normal  0.384073 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5774  ribosomal protein S14  53.68 
 
 		 89 aa  100  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0491474  normal  0.403708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0615  ribosomal protein S14  53.68 
 
 		 89 aa  100  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2051  30S ribosomal protein S14  56.84 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000573988  normal  0.404891 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1588  30S ribosomal protein S14  51 
 
 		 100 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1613  30S ribosomal protein S14  51 
 
 		 100 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0063  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000147602  hitchhiker  8.43834e-17 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0066  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185817  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0446  30S ribosomal protein S14  51 
 
 		 100 aa  99.4  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3311  30S ribosomal protein S14  47 
 
 		 100 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0267  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  97.4  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0687464  normal  0.437866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3919  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  97.1  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3149  SSU ribosomal protein S14P  49.47 
 
 		 89 aa  97.1  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.457334  normal  0.581688 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03158  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000309801  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0406  ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000311581  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3692  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000389079  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4630  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000273788  normal  0.541186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3602  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000121429  normal  0.0164764 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0406  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000372668  hitchhiker  0.0000137856 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3501  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690284  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03109  hypothetical protein  50.5 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000139286  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3790  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683698  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0374  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3791  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0910984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3733  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000471214  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2619  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00326557  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2521  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3763  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000751024  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1728  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133378  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0194  30S ribosomal protein S14  53.68 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.482071  normal  0.975844 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3491  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0297589  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1424  30S ribosomal protein S14  53.68 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000838917  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3055  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000566724  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0855  ribosomal protein S14  50.53 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0471  SSU ribosomal protein S14P  51.49 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1937  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000295863  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1397  30S ribosomal protein S14  53.68 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000161259  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3156  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000867559  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3304  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00814384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2216  30S ribosomal protein S14  52.63 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050188  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0614  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 		 101 aa  94.7  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0905  30S ribosomal protein S14  52.63 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3731  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0634763  normal  0.0239339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3623  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00146543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3794  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3696  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00964578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3623  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000455836  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1035  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0604  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2311  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170574  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0732  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0027936  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0386  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000402264  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0340  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119907  normal  0.0120704 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0262  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  93.6  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000389455  hitchhiker  0.00180816 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2746  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000874703  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0394  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000622338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0289  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000215365  normal  0.0115353 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0280  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000109456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0361  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000769371  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0769  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  93.6  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0657846  normal  0.0117281 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2283  30S ribosomal protein S14  52.63 
 
 		 89 aa  93.6  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000126284  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0336  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  93.6  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00010429  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3460  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  93.6  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000254777  decreased coverage  0.00448614 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0069  ribosomal protein S14  50 
 
 		 100 aa  93.2  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.590343  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1002  ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  93.6  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000566034  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3006  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239301  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1340  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843719  normal  0.149539 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0557  ribosomal protein S14  50.53 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.67281  normal  0.167301 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3738  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000436001  decreased coverage  0.00101243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1628  ribosomal protein S14  49.47 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4230  30S ribosomal protein S14  50.52 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1921  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0296  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000386262  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0298  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1077  30S ribosomal protein S14  51.58 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271481  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0418  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000392658  normal  0.228151 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1732  30S ribosomal protein S14  47 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0972  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000120415  hitchhiker  0.000000929871 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0596  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000010236  normal  0.493148 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2937  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000210491  hitchhiker  0.000000785932 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1360  30S ribosomal protein S14  51.58 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3284  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000159441  hitchhiker  0.00000214685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>