More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0905 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0905  30S ribosomal protein S14  100 
 
 		 89 aa  181  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1424  30S ribosomal protein S14  97.75 
 
 		 89 aa  177  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000838917  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1397  30S ribosomal protein S14  97.75 
 
 		 89 aa  177  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000161259  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1754  30S ribosomal protein S14  68.54 
 
 		 89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00383016  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05785  ribosomal protein S14  61.8 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1077  30S ribosomal protein S14  66.29 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271481  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0855  ribosomal protein S14  62.92 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4356  ribosomal protein S14  61.8 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629115  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1160  30S ribosomal protein S14  60.67 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204573  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1360  30S ribosomal protein S14  60.67 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0615  ribosomal protein S14  60.67 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5774  ribosomal protein S14  59.55 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0491474  normal  0.403708 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0384  30S ribosomal protein S14  58.43 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1925  30S ribosomal protein S14  58.43 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0557  ribosomal protein S14  57.3 
 
 		 89 aa  107  8.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.67281  normal  0.167301 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2216  30S ribosomal protein S14  60.67 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050188  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1838  30S ribosomal protein S14  59.55 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247662  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0302  30S ribosomal protein S14  60.67 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2051  30S ribosomal protein S14  60.67 
 
 		 89 aa  104  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000573988  normal  0.404891 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0194  30S ribosomal protein S14  60.67 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.482071  normal  0.975844 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0184  30S ribosomal protein S14  57.3 
 
 		 89 aa  103  9e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.282468 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3149  SSU ribosomal protein S14P  53.93 
 
 		 89 aa  102  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.457334  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2410  30S ribosomal protein S14  58.43 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00120885  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2283  30S ribosomal protein S14  56.18 
 
 		 89 aa  100  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000126284  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0168  ribosomal protein S14  58.43 
 
 		 85 aa  100  9e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000187537  hitchhiker  3.50786e-17 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1628  ribosomal protein S14  52.81 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0605  ribosomal protein S14  55.1 
 
 		 98 aa  97.1  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0732  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  97.1  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0027936  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0285  ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.28128  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0073  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1272  ribosomal protein S14  52.63 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2606  30S ribosomal protein S14  56.18 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3511  ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000387623  hitchhiker  0.0000000964765 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2156  ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.11906  normal  0.323543 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0439  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000050629  hitchhiker  0.0000949985 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03158  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000309801  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0406  ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000311581  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03109  hypothetical protein  51.49 
 
 		 101 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000139286  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0406  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000372668  hitchhiker  0.0000137856 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3692  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  90.5  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000389079  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3501  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3602  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000121429  normal  0.0164764 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4630  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000273788  normal  0.541186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3790  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683698  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5491  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal  0.0421593 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19170  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  90.5  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.205421  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0418  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  90.5  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000392658  normal  0.228151 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3982  ribosomal protein S14  52.63 
 
 		 95 aa  90.1  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3373  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  90.1  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.773446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0170  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  89.4  1e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0625334  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3270  30S ribosomal protein S14  50 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0411187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3311  30S ribosomal protein S14  50 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1310  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1030  SSU ribosomal protein S14P  56.18 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000126459  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0418  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  89.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000405009  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3936  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  88.6  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3731  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0634763  normal  0.0239339 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3696  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00964578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00951  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  88.2  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288651  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3623  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00146543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3794  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3623  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000455836  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0267  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  87.8  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0687464  normal  0.437866 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3738  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  87.4  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000436001  decreased coverage  0.00101243 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0972  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  87.8  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000120415  hitchhiker  0.000000929871 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5057  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  87.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0176804  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3901  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000036501  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0296  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000386262  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0596  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  87.4  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000010236  normal  0.493148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1002  ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  87.4  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000566034  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0336  ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442149  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0434  SSU ribosomal protein S14P  50.5 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0108067  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3006  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239301  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3721  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3293  ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2822  ribosomal protein S14  48 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00224384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4263  ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526043  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3919  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0336  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00010429  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12771  30S ribosomal protein S14  49 
 
 		 100 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.292627  normal  0.0214464 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1613  30S ribosomal protein S14  51 
 
 		 100 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3284  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000159441  hitchhiker  0.00000214685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3304  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00814384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0567  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1588  30S ribosomal protein S14  51 
 
 		 100 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2937  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000210491  hitchhiker  0.000000785932 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0614  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1793  30S ribosomal protein S14  45 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.321524  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1921  30S ribosomal protein S14  44.55 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0604  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001729  SSU ribosomal protein S14p (S29e)  49.5 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000996787  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0332  SSU ribosomal protein S14P  46.53 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.84975e-18  unclonable  0.0000000474236 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2151  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1367  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.733722  normal  0.0818986 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0298  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00743  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  84  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36480  SSU ribosomal protein S14P  46.53 
 
 		 101 aa  84  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.833214 
 
 
-
 
NC_002978  WD0668  30S ribosomal protein S14  44.12 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.549437  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13831  30S ribosomal protein S14  47 
 
 		 100 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0471  SSU ribosomal protein S14P  48.51 
 
 		 101 aa  83.6  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>