More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2216 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2216  30S ribosomal protein S14  100 
 
 		 89 aa  177  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050188  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0194  30S ribosomal protein S14  92.13 
 
 		 89 aa  169  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.482071  normal  0.975844 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2410  30S ribosomal protein S14  89.89 
 
 		 89 aa  164  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00120885  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2051  30S ribosomal protein S14  88.76 
 
 		 89 aa  161  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000573988  normal  0.404891 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0302  30S ribosomal protein S14  88.76 
 
 		 89 aa  160  6e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2283  30S ribosomal protein S14  85.39 
 
 		 89 aa  157  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000126284  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1838  30S ribosomal protein S14  84.27 
 
 		 89 aa  155  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0855  ribosomal protein S14  61.8 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0184  30S ribosomal protein S14  60.67 
 
 		 89 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.282468 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0615  ribosomal protein S14  61.8 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05785  ribosomal protein S14  59.55 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0905  30S ribosomal protein S14  60.67 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1397  30S ribosomal protein S14  60.67 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000161259  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1424  30S ribosomal protein S14  60.67 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000838917  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0384  30S ribosomal protein S14  57.3 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1160  30S ribosomal protein S14  57.3 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204573  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1754  30S ribosomal protein S14  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00383016  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4356  ribosomal protein S14  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629115  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5774  ribosomal protein S14  58.43 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0491474  normal  0.403708 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3270  30S ribosomal protein S14  56 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0411187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1628  ribosomal protein S14  52.81 
 
 		 89 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0418  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000392658  normal  0.228151 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1793  30S ribosomal protein S14  51 
 
 		 100 aa  99  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.321524  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3149  SSU ribosomal protein S14P  53.93 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.457334  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1588  30S ribosomal protein S14  55 
 
 		 100 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1613  30S ribosomal protein S14  55 
 
 		 100 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1291  30S ribosomal protein S14  54 
 
 		 100 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0446  30S ribosomal protein S14  52 
 
 		 100 aa  98.2  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1925  30S ribosomal protein S14  55.06 
 
 		 89 aa  97.8  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0308  ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  97.4  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000208826  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1732  30S ribosomal protein S14  52 
 
 		 100 aa  96.7  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12771  30S ribosomal protein S14  52 
 
 		 100 aa  95.9  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.292627  normal  0.0214464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3311  30S ribosomal protein S14  50 
 
 		 100 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0809  30S ribosomal protein S14  50 
 
 		 100 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.815003  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16641  30S ribosomal protein S14  50 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0663388  normal  0.91596 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13911  30S ribosomal protein S14  51 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13831  30S ribosomal protein S14  51 
 
 		 100 aa  94.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1272  ribosomal protein S14  52.63 
 
 		 95 aa  94.7  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0972  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000120415  hitchhiker  0.000000929871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3919  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  94.4  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0332  SSU ribosomal protein S14P  51.49 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.84975e-18  unclonable  0.0000000474236 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04508  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0212476  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0434  SSU ribosomal protein S14P  52.48 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0108067  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3325  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000022678  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3721  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5057  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0176804  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0668  30S ribosomal protein S14  48.04 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.549437  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3982  ribosomal protein S14  51.58 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1360  30S ribosomal protein S14  52.81 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2156  ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.11906  normal  0.323543 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0285  ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.28128  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2726  30S ribosomal protein S14  51.58 
 
 		 95 aa  90.5  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0292  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  90.1  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000253774  hitchhiker  0.00000211438 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19170  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  89.4  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.205421  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2822  ribosomal protein S14  48 
 
 		 100 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00224384 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0769  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  89.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0657846  normal  0.0117281 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0446  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  90.1  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0684905  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0507  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  90.1  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.245426  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2359  ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06031  30S ribosomal protein S14  48 
 
 		 100 aa  88.6  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.218284 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1077  30S ribosomal protein S14  52.81 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271481  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2311  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170574  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0467  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00078968  hitchhiker  0.00000305269 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0500  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000825135  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06380  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  88.2  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000466931  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0336  ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  88.6  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442149  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4263  ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  88.2  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526043  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0502  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  87.8  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000100367  hitchhiker  0.00403438 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0780  ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  87.8  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000315773  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0497  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  87.8  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000674394  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0439  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  87.8  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000050629  hitchhiker  0.0000949985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4736  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000804532  normal  0.483831 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0063  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  87  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000147602  hitchhiker  8.43834e-17 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0066  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185817  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2905  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  87  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378522  normal  0.633116 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13621  30S ribosomal protein S14  48.42 
 
 		 95 aa  85.9  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0340  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119907  normal  0.0120704 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0497  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0262  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000389455  hitchhiker  0.00180816 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2746  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000874703  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0073  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0280  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000109456  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0289  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000215365  normal  0.0115353 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0361  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000769371  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3293  ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3006  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239301  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2853  30S ribosomal protein S14  43.56 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544731  normal  0.525302 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3460  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000254777  decreased coverage  0.00448614 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0327  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000923882  decreased coverage  0.00287275 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3304  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00814384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0471  SSU ribosomal protein S14P  48.51 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3631  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000617714  decreased coverage  0.00000000000127186 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3733  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000471214  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2619  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00326557  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3791  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0910984  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3373  30S ribosomal protein S14  43.56 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.773446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3763  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000751024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1937  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000295863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3055  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000566724  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3491  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0297589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>