More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1291 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1291  30S ribosomal protein S14  100 
 
 		 100 aa  205  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13911  30S ribosomal protein S14  97 
 
 		 100 aa  201  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13831  30S ribosomal protein S14  96 
 
 		 100 aa  200  6e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12771  30S ribosomal protein S14  91 
 
 		 100 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.292627  normal  0.0214464 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16641  30S ribosomal protein S14  91 
 
 		 100 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0663388  normal  0.91596 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0809  30S ribosomal protein S14  90 
 
 		 100 aa  190  5e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.815003  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13621  30S ribosomal protein S14  93.68 
 
 		 95 aa  187  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1793  30S ribosomal protein S14  84 
 
 		 100 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.321524  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06031  30S ribosomal protein S14  86 
 
 		 100 aa  164  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.218284 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0571  30S ribosomal protein S14  86 
 
 		 100 aa  157  4e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.635096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0446  30S ribosomal protein S14  74 
 
 		 100 aa  157  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1732  30S ribosomal protein S14  73 
 
 		 100 aa  156  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1613  30S ribosomal protein S14  69 
 
 		 100 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1588  30S ribosomal protein S14  69 
 
 		 100 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3270  30S ribosomal protein S14  68 
 
 		 100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0411187  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2726  30S ribosomal protein S14  70.53 
 
 		 95 aa  143  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3311  30S ribosomal protein S14  63 
 
 		 100 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2822  ribosomal protein S14  63 
 
 		 100 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00224384 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0332  SSU ribosomal protein S14P  56.44 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.84975e-18  unclonable  0.0000000474236 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0471  SSU ribosomal protein S14P  55.45 
 
 		 101 aa  110  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0439  30S ribosomal protein S14  53.4 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000050629  hitchhiker  0.0000949985 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0845  ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  107  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0434  SSU ribosomal protein S14P  54.37 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0108067  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2937  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000210491  hitchhiker  0.000000785932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3284  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000159441  hitchhiker  0.00000214685 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0502  30S ribosomal protein S14  51.46 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000100367  hitchhiker  0.00403438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0497  30S ribosomal protein S14  51.46 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000674394  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04508  30S ribosomal protein S14  52.43 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0212476  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3325  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  104  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000022678  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0972  30S ribosomal protein S14  51.46 
 
 		 101 aa  104  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000120415  hitchhiker  0.000000929871 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3006  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 		 101 aa  103  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239301  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0780  ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  103  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000315773  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0446  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 		 101 aa  102  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0684905  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0507  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 		 101 aa  102  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.245426  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0292  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000253774  hitchhiker  0.00000211438 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0418  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  101  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000392658  normal  0.228151 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4263  ribosomal protein S14  52.43 
 
 		 101 aa  101  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526043  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0374  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1728  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133378  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2521  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1921  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  100  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2156  ribosomal protein S14  53.85 
 
 		 101 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.11906  normal  0.323543 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0340  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  100  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0262  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  100  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000389455  hitchhiker  0.00180816 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0289  30S ribosomal protein S14  50 
 
 		 101 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000215365  normal  0.0115353 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2746  30S ribosomal protein S14  50 
 
 		 101 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000874703  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0340  30S ribosomal protein S14  50 
 
 		 101 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119907  normal  0.0120704 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0280  30S ribosomal protein S14  50 
 
 		 101 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000109456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0361  30S ribosomal protein S14  50 
 
 		 101 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000769371  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0063  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  100  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000147602  hitchhiker  8.43834e-17 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0066  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185817  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3460  30S ribosomal protein S14  50 
 
 		 101 aa  99.4  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000254777  decreased coverage  0.00448614 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0769  30S ribosomal protein S14  49.02 
 
 		 101 aa  99.4  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0657846  normal  0.0117281 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2359  ribosomal protein S14  53.47 
 
 		 101 aa  99.4  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0308  ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  98.6  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000208826  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5057  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  99.4  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0176804  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2311  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  98.6  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170574  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2619  30S ribosomal protein S14  48.54 
 
 		 101 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00326557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3733  30S ribosomal protein S14  48.54 
 
 		 101 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000471214  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3491  30S ribosomal protein S14  48.54 
 
 		 101 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0297589  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3763  30S ribosomal protein S14  48.54 
 
 		 101 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000751024  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3055  30S ribosomal protein S14  48.54 
 
 		 101 aa  98.6  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000566724  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1937  30S ribosomal protein S14  48.54 
 
 		 101 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000295863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3791  30S ribosomal protein S14  48.54 
 
 		 101 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0910984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3156  30S ribosomal protein S14  48.54 
 
 		 101 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000867559  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2216  30S ribosomal protein S14  54 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050188  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3430  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.243103  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3304  30S ribosomal protein S14  49.51 
 
 		 101 aa  97.1  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00814384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1340  30S ribosomal protein S14  52.43 
 
 		 101 aa  96.7  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843719  normal  0.149539 
 
 
-
 
NC_002978  WD0668  30S ribosomal protein S14  50.96 
 
 		 102 aa  96.7  9e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.549437  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2051  30S ribosomal protein S14  53 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000573988  normal  0.404891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2205  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2826  30S ribosomal protein S14  47.57 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591493  normal  0.456449 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2311  ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000376019  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0194  30S ribosomal protein S14  50 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.482071  normal  0.975844 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3936  30S ribosomal protein S14  48.54 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0073  30S ribosomal protein S14  50.49 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2151  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3166  30S ribosomal protein S14  47.57 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000693481  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06380  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000466931  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5066  30S ribosomal protein S14  49.51 
 
 		 101 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000167621  normal  0.114431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3721  30S ribosomal protein S14  50 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0267  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  94.4  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0687464  normal  0.437866 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2283  30S ribosomal protein S14  52 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000126284  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0772  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  94  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51274  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2188  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.913907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2466  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2410  30S ribosomal protein S14  50 
 
 		 89 aa  93.6  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00120885  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0333  30S ribosomal protein S14  44.66 
 
 		 101 aa  93.6  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000766053  hitchhiker  0.000426271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0605  ribosomal protein S14  49 
 
 		 98 aa  93.6  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00951  30S ribosomal protein S14  49.51 
 
 		 101 aa  93.6  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288651  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0639  ribosomal protein S14  49.51 
 
 		 101 aa  93.2  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000000461822  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0467  30S ribosomal protein S14  49.51 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00078968  hitchhiker  0.00000305269 
 
 
-
 
NC_002950  PG1925  30S ribosomal protein S14  49 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0488  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000639761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2805  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539681  normal  0.449731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0500  30S ribosomal protein S14  49.51 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000825135  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0298  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0327  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000923882  decreased coverage  0.00287275 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0732  30S ribosomal protein S14  48.54 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0027936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>