More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1588 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1613  30S ribosomal protein S14  100 
 
 
100 aa  206  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1588  30S ribosomal protein S14  100 
 
 
100 aa  206  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1732  30S ribosomal protein S14  85 
 
 
100 aa  176  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2822  ribosomal protein S14  81 
 
 
100 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00224384 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3270  30S ribosomal protein S14  80 
 
 
100 aa  169  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0411187  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0446  30S ribosomal protein S14  77 
 
 
100 aa  166  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2726  30S ribosomal protein S14  81.05 
 
 
95 aa  162  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3311  30S ribosomal protein S14  74 
 
 
100 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0809  30S ribosomal protein S14  70 
 
 
100 aa  146  8e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.815003  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13831  30S ribosomal protein S14  70 
 
 
100 aa  146  9e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1291  30S ribosomal protein S14  69 
 
 
100 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16641  30S ribosomal protein S14  69 
 
 
100 aa  145  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0663388  normal  0.91596 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13911  30S ribosomal protein S14  69 
 
 
100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1793  30S ribosomal protein S14  68 
 
 
100 aa  144  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.321524  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12771  30S ribosomal protein S14  68 
 
 
100 aa  144  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.292627  normal  0.0214464 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13621  30S ribosomal protein S14  66.32 
 
 
95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06031  30S ribosomal protein S14  69 
 
 
100 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.218284 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0289  30S ribosomal protein S14  60.4 
 
 
101 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000215365  normal  0.0115353 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2746  30S ribosomal protein S14  60.4 
 
 
101 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000874703  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0262  30S ribosomal protein S14  60.4 
 
 
101 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000389455  hitchhiker  0.00180816 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0280  30S ribosomal protein S14  60.4 
 
 
101 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000109456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0361  30S ribosomal protein S14  60.4 
 
 
101 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000769371  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0340  30S ribosomal protein S14  60.4 
 
 
101 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119907  normal  0.0120704 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0571  30S ribosomal protein S14  69 
 
 
100 aa  121  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.635096  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3460  30S ribosomal protein S14  59.41 
 
 
101 aa  120  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000254777  decreased coverage  0.00448614 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0471  SSU ribosomal protein S14P  59.41 
 
 
101 aa  119  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3006  30S ribosomal protein S14  59.41 
 
 
101 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239301  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0308  ribosomal protein S14  57.43 
 
 
101 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000208826  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0434  SSU ribosomal protein S14P  61.76 
 
 
101 aa  117  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0108067  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2937  30S ribosomal protein S14  58.42 
 
 
101 aa  115  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000210491  hitchhiker  0.000000785932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3284  30S ribosomal protein S14  58.42 
 
 
101 aa  115  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000159441  hitchhiker  0.00000214685 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04508  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0212476  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2156  ribosomal protein S14  59.41 
 
 
101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.11906  normal  0.323543 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0845  ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0772  30S ribosomal protein S14  59.41 
 
 
101 aa  114  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51274  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3166  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000693481  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2826  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591493  normal  0.456449 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2311  30S ribosomal protein S14  57.43 
 
 
101 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170574  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1937  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000295863  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2619  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00326557  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0418  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 
101 aa  113  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000392658  normal  0.228151 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3491  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0297589  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3763  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000751024  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3055  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000566724  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3791  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0910984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3733  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000471214  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3156  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000867559  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0439  30S ribosomal protein S14  59.8 
 
 
101 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000050629  hitchhiker  0.0000949985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3304  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00814384  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0502  30S ribosomal protein S14  57.43 
 
 
101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000100367  hitchhiker  0.00403438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0497  30S ribosomal protein S14  57.43 
 
 
101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000674394  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3631  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  110  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000617714  decreased coverage  0.00000000000127186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0327  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  110  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000923882  decreased coverage  0.00287275 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0063  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  110  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000147602  hitchhiker  8.43834e-17 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0066  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  110  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0340  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0446  30S ribosomal protein S14  57.43 
 
 
101 aa  110  9e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0684905  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0507  30S ribosomal protein S14  57.43 
 
 
101 aa  110  9e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.245426  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1728  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133378  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0374  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0972  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000120415  hitchhiker  0.000000929871 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3325  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 
101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000022678  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2521  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0769  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 
101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0657846  normal  0.0117281 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2205  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  107  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404877  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0298  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  107  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1921  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1782  SSU ribosomal protein S14P  54.46 
 
 
101 aa  106  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0484502  normal  0.0815843 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3982  ribosomal protein S14  54 
 
 
95 aa  106  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0267  30S ribosomal protein S14  57.43 
 
 
101 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0687464  normal  0.437866 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1160  30S ribosomal protein S14  57 
 
 
89 aa  105  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204573  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05785  ribosomal protein S14  56 
 
 
89 aa  105  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0332  SSU ribosomal protein S14P  53.47 
 
 
101 aa  104  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.84975e-18  unclonable  0.0000000474236 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0604  30S ribosomal protein S14  55.88 
 
 
101 aa  104  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.472799  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3936  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2151  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0292  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000253774  hitchhiker  0.00000211438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5057  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0176804  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2466  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18853  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2188  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.913907  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2311  ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  101  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000376019  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4263  ribosomal protein S14  56.86 
 
 
101 aa  101  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526043  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1665  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  100  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0077571  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1925  30S ribosomal protein S14  57.43 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1272  ribosomal protein S14  51 
 
 
95 aa  99.4  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00951  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288651  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3430  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  99.4  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.243103  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0384  30S ribosomal protein S14  56 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2359  ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  99  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2051  30S ribosomal protein S14  57 
 
 
89 aa  99  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000573988  normal  0.404891 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0184  30S ribosomal protein S14  55 
 
 
89 aa  99  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.282468 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0567  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  99  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0488  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000639761  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0668  30S ribosomal protein S14  50 
 
 
102 aa  98.6  3e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.549437  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3919  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  98.6  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2216  30S ribosomal protein S14  55 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050188  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2312  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  98.2  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00369177  normal  0.384073 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1367  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  97.4  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.733722  normal  0.0818986 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0333  30S ribosomal protein S14  46.6 
 
 
101 aa  97.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000766053  hitchhiker  0.000426271 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0194  30S ribosomal protein S14  55 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.482071  normal  0.975844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>