More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0340 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0340  30S ribosomal protein S14  100 
 
 
101 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119907  normal  0.0120704 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0289  30S ribosomal protein S14  100 
 
 
101 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000215365  normal  0.0115353 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2746  30S ribosomal protein S14  100 
 
 
101 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000874703  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0280  30S ribosomal protein S14  100 
 
 
101 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000109456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0361  30S ribosomal protein S14  100 
 
 
101 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000769371  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3460  30S ribosomal protein S14  99.01 
 
 
101 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000254777  decreased coverage  0.00448614 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0262  30S ribosomal protein S14  99.01 
 
 
101 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000389455  hitchhiker  0.00180816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3166  30S ribosomal protein S14  91.09 
 
 
101 aa  185  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000693481  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2826  30S ribosomal protein S14  91.09 
 
 
101 aa  185  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591493  normal  0.456449 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3006  30S ribosomal protein S14  89.11 
 
 
101 aa  184  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239301  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3304  30S ribosomal protein S14  89.11 
 
 
101 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00814384  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3284  30S ribosomal protein S14  88.12 
 
 
101 aa  181  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000159441  hitchhiker  0.00000214685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2937  30S ribosomal protein S14  88.12 
 
 
101 aa  181  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000210491  hitchhiker  0.000000785932 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2619  30S ribosomal protein S14  88.12 
 
 
101 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00326557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3763  30S ribosomal protein S14  88.12 
 
 
101 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000751024  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3055  30S ribosomal protein S14  88.12 
 
 
101 aa  179  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000566724  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3733  30S ribosomal protein S14  88.12 
 
 
101 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000471214  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1937  30S ribosomal protein S14  88.12 
 
 
101 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000295863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3791  30S ribosomal protein S14  88.12 
 
 
101 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0910984  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3491  30S ribosomal protein S14  88.12 
 
 
101 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0297589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3156  30S ribosomal protein S14  88.12 
 
 
101 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000867559  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3631  30S ribosomal protein S14  87.13 
 
 
101 aa  177  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000617714  decreased coverage  0.00000000000127186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0327  30S ribosomal protein S14  87.13 
 
 
101 aa  177  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000923882  decreased coverage  0.00287275 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0066  30S ribosomal protein S14  80.2 
 
 
101 aa  167  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185817  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0063  30S ribosomal protein S14  80.2 
 
 
101 aa  167  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000147602  hitchhiker  8.43834e-17 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3325  30S ribosomal protein S14  79.21 
 
 
101 aa  161  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000022678  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3936  30S ribosomal protein S14  75.25 
 
 
101 aa  156  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5057  30S ribosomal protein S14  74.26 
 
 
101 aa  150  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0176804  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0333  30S ribosomal protein S14  72.28 
 
 
101 aa  148  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000766053  hitchhiker  0.000426271 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2312  30S ribosomal protein S14  73.27 
 
 
101 aa  148  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00369177  normal  0.384073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0488  30S ribosomal protein S14  73.27 
 
 
101 aa  147  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000639761  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0332  SSU ribosomal protein S14P  68.32 
 
 
101 aa  147  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.84975e-18  unclonable  0.0000000474236 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3430  30S ribosomal protein S14  70.3 
 
 
101 aa  147  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.243103  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4230  30S ribosomal protein S14  71.43 
 
 
98 aa  141  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0434  SSU ribosomal protein S14P  63.37 
 
 
101 aa  140  8e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0108067  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0418  30S ribosomal protein S14  66.34 
 
 
101 aa  138  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000392658  normal  0.228151 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4263  ribosomal protein S14  61.39 
 
 
101 aa  137  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526043  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0614  30S ribosomal protein S14  73.27 
 
 
101 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255851  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0471  SSU ribosomal protein S14P  61.39 
 
 
101 aa  137  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1035  30S ribosomal protein S14  72.28 
 
 
101 aa  135  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352653  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0386  30S ribosomal protein S14  72.28 
 
 
101 aa  135  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000402264  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0394  30S ribosomal protein S14  72.28 
 
 
101 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000622338  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0845  ribosomal protein S14  63.37 
 
 
101 aa  135  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2156  ribosomal protein S14  63.37 
 
 
101 aa  134  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.11906  normal  0.323543 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0292  30S ribosomal protein S14  61.39 
 
 
101 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000253774  hitchhiker  0.00000211438 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00951  30S ribosomal protein S14  63.37 
 
 
101 aa  133  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288651  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0780  ribosomal protein S14  58.42 
 
 
101 aa  130  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000315773  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0732  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  130  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0027936  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0308  ribosomal protein S14  60.4 
 
 
101 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000208826  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0439  30S ribosomal protein S14  60.4 
 
 
101 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000050629  hitchhiker  0.0000949985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0972  30S ribosomal protein S14  58.42 
 
 
101 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000120415  hitchhiker  0.000000929871 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0502  30S ribosomal protein S14  60.4 
 
 
101 aa  128  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000100367  hitchhiker  0.00403438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0497  30S ribosomal protein S14  60.4 
 
 
101 aa  128  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000674394  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0614  30S ribosomal protein S14  59.41 
 
 
101 aa  127  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001729  SSU ribosomal protein S14p (S29e)  62.38 
 
 
101 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000996787  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00743  30S ribosomal protein S14  62.38 
 
 
101 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0073  30S ribosomal protein S14  60.4 
 
 
101 aa  127  8.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1002  ribosomal protein S14  62.38 
 
 
101 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000566034  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0507  30S ribosomal protein S14  58.42 
 
 
101 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.245426  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0446  30S ribosomal protein S14  58.42 
 
 
101 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0684905  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4304  30S ribosomal protein S14  60.4 
 
 
101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000890195  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04508  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0212476  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0212  30S ribosomal protein S14  60.4 
 
 
101 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000559885  unclonable  0.0000000000128265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0207  30S ribosomal protein S14  60.4 
 
 
101 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000156094  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0197  30S ribosomal protein S14  59.41 
 
 
101 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337637  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0212  30S ribosomal protein S14  60.4 
 
 
101 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000604107  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4677  30S ribosomal protein S14  59.41 
 
 
101 aa  124  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000132516  unclonable  0.00000000984925 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2161  30S ribosomal protein S14  60.4 
 
 
101 aa  124  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000755584  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0171  30S ribosomal protein S14  59.41 
 
 
101 aa  124  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  decreased coverage  0.0000502877 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0333  30S ribosomal protein S14  59.41 
 
 
101 aa  124  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3511  ribosomal protein S14  55.45 
 
 
101 aa  123  8.000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000387623  hitchhiker  0.0000000964765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0340  30S ribosomal protein S14  58.42 
 
 
101 aa  123  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0244  30S ribosomal protein S14  59.41 
 
 
101 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2311  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 
101 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170574  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0418  30S ribosomal protein S14  60.4 
 
 
101 aa  122  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000405009  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0161  30S ribosomal protein S14  60.4 
 
 
101 aa  123  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000142165  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1613  30S ribosomal protein S14  60.4 
 
 
100 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0296  30S ribosomal protein S14  58.42 
 
 
101 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000386262  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1588  30S ribosomal protein S14  60.4 
 
 
100 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5066  30S ribosomal protein S14  58.42 
 
 
101 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000167621  normal  0.114431 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3901  30S ribosomal protein S14  58.42 
 
 
101 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000036501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0596  30S ribosomal protein S14  58.42 
 
 
101 aa  122  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000010236  normal  0.493148 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4535  30S ribosomal protein S14  58.42 
 
 
101 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0668255  normal  0.120903 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4157  30S ribosomal protein S14  58.42 
 
 
101 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000237704  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03158  30S ribosomal protein S14  59.41 
 
 
101 aa  121  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000309801  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0406  ribosomal protein S14  59.41 
 
 
101 aa  121  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000311581  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3501  30S ribosomal protein S14  59.41 
 
 
101 aa  121  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690284  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0213  30S ribosomal protein S14  58.42 
 
 
101 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000765112  unclonable  0.00000853869 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0406  30S ribosomal protein S14  59.41 
 
 
101 aa  121  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000372668  hitchhiker  0.0000137856 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3790  30S ribosomal protein S14  59.41 
 
 
101 aa  121  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683698  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4043  30S ribosomal protein S14  58.42 
 
 
101 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000318217  unclonable  0.00000000000274518 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4630  30S ribosomal protein S14  59.41 
 
 
101 aa  121  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000273788  normal  0.541186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3602  30S ribosomal protein S14  59.41 
 
 
101 aa  121  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000121429  normal  0.0164764 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0209  30S ribosomal protein S14  58.42 
 
 
101 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434806  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3692  30S ribosomal protein S14  59.41 
 
 
101 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000389079  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3746  30S ribosomal protein S14  58.42 
 
 
101 aa  121  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000320065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03109  hypothetical protein  59.41 
 
 
101 aa  121  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000139286  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0298  30S ribosomal protein S14  57.43 
 
 
101 aa  120  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3896  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  120  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000012312  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0183  30S ribosomal protein S14  58.42 
 
 
101 aa  120  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000146955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>