More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1925 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1925  30S ribosomal protein S14  100 
 
 
89 aa  180  5.0000000000000004e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1160  30S ribosomal protein S14  85.39 
 
 
89 aa  157  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204573  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0384  30S ribosomal protein S14  79.78 
 
 
89 aa  148  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05785  ribosomal protein S14  78.65 
 
 
89 aa  148  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5774  ribosomal protein S14  76.4 
 
 
89 aa  142  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0491474  normal  0.403708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0615  ribosomal protein S14  74.16 
 
 
89 aa  139  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1628  ribosomal protein S14  71.91 
 
 
89 aa  133  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4356  ribosomal protein S14  67.42 
 
 
89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629115  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3149  SSU ribosomal protein S14P  66.29 
 
 
89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.457334  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0184  30S ribosomal protein S14  69.66 
 
 
89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.282468 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0855  ribosomal protein S14  65.17 
 
 
89 aa  118  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1360  30S ribosomal protein S14  61.8 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00951  30S ribosomal protein S14  59.41 
 
 
101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288651  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3511  ribosomal protein S14  57.43 
 
 
101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000387623  hitchhiker  0.0000000964765 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1002  ribosomal protein S14  57.43 
 
 
101 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000566034  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3746  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  107  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000320065  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4677  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  107  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000132516  unclonable  0.00000000984925 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0905  30S ribosomal protein S14  58.43 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1424  30S ribosomal protein S14  58.43 
 
 
89 aa  106  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000838917  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1397  30S ribosomal protein S14  58.43 
 
 
89 aa  106  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000161259  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0614  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 
101 aa  105  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0171  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  decreased coverage  0.0000502877 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3982  ribosomal protein S14  56.84 
 
 
95 aa  106  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4304  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000890195  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0197  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337637  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00743  30S ribosomal protein S14  57.43 
 
 
101 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4157  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000237704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0213  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000765112  unclonable  0.00000853869 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001729  SSU ribosomal protein S14p (S29e)  56.44 
 
 
101 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000996787  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4043  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000318217  unclonable  0.00000000000274518 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0209  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434806  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03158  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000309801  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0406  ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000311581  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03109  hypothetical protein  56.44 
 
 
101 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000139286  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3790  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683698  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4630  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000273788  normal  0.541186 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0406  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000372668  hitchhiker  0.0000137856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0212  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  104  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000559885  unclonable  0.0000000000128265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0207  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  104  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000156094  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3692  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000389079  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0212  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000604107  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3602  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000121429  normal  0.0164764 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3501  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0596  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 
101 aa  104  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000010236  normal  0.493148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0296  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 
101 aa  104  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000386262  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0502  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  104  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000100367  hitchhiker  0.00403438 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0333  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 
101 aa  104  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0497  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  104  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000674394  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3901  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 
101 aa  104  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000036501  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0439  30S ribosomal protein S14  57.43 
 
 
101 aa  104  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000050629  hitchhiker  0.0000949985 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0226  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  104  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000624437  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3006  30S ribosomal protein S14  57.43 
 
 
101 aa  103  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239301  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3284  30S ribosomal protein S14  57.43 
 
 
101 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000159441  hitchhiker  0.00000214685 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0557  ribosomal protein S14  55.06 
 
 
89 aa  104  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.67281  normal  0.167301 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2937  30S ribosomal protein S14  57.43 
 
 
101 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000210491  hitchhiker  0.000000785932 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1077  30S ribosomal protein S14  58.43 
 
 
89 aa  104  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271481  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0161  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  104  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000142165  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1272  ribosomal protein S14  54.74 
 
 
95 aa  103  6e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0418  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 
101 aa  103  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000405009  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0336  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  103  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00010429  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0244  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  103  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5057  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  103  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0176804  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3623  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 
101 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000455836  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0066  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  102  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185817  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3731  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 
101 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0634763  normal  0.0239339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3623  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 
101 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00146543  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3794  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 
101 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3696  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 
101 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00964578  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0183  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000146955  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0063  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000147602  hitchhiker  8.43834e-17 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2161  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000755584  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3988  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  101  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168121  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3809  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  101  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000276369  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0732  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0027936  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0298  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  101  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1754  30S ribosomal protein S14  56.18 
 
 
89 aa  100  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00383016  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3738  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  100  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000436001  decreased coverage  0.00101243 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2051  30S ribosomal protein S14  57.3 
 
 
89 aa  100  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000573988  normal  0.404891 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0340  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119907  normal  0.0120704 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0262  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  100  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000389455  hitchhiker  0.00180816 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3460  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  100  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000254777  decreased coverage  0.00448614 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0289  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000215365  normal  0.0115353 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2746  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000874703  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0280  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000109456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0361  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000769371  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0434  SSU ribosomal protein S14P  53.47 
 
 
101 aa  100  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0108067  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1613  30S ribosomal protein S14  57.43 
 
 
100 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1588  30S ribosomal protein S14  57.43 
 
 
100 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3311  30S ribosomal protein S14  52 
 
 
100 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2312  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  98.6  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00369177  normal  0.384073 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0418  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  99  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000392658  normal  0.228151 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4263  ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  98.6  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526043  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0488  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000639761  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0333  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  99  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000766053  hitchhiker  0.000426271 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4531  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168728  hitchhiker  0.000580977 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1728  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133378  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0308  ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  98.2  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000208826  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2521  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0374  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2311  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>