More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1077 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1077  30S ribosomal protein S14  100 
 
 		 89 aa  180  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271481  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1360  30S ribosomal protein S14  76.4 
 
 		 89 aa  142  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1754  30S ribosomal protein S14  70.79 
 
 		 89 aa  130  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00383016  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5774  ribosomal protein S14  65.17 
 
 		 89 aa  120  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0491474  normal  0.403708 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4356  ribosomal protein S14  61.8 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629115  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0615  ribosomal protein S14  64.04 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1424  30S ribosomal protein S14  67.42 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000838917  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1397  30S ribosomal protein S14  67.42 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000161259  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0855  ribosomal protein S14  64.04 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0905  30S ribosomal protein S14  66.29 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05785  ribosomal protein S14  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3149  SSU ribosomal protein S14P  58.43 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.457334  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1030  SSU ribosomal protein S14P  71.91 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000126459  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0168  ribosomal protein S14  62.92 
 
 		 85 aa  110  8.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000187537  hitchhiker  3.50786e-17 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0384  30S ribosomal protein S14  58.43 
 
 		 89 aa  108  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1628  ribosomal protein S14  59.55 
 
 		 89 aa  106  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1160  30S ribosomal protein S14  58.43 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204573  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1925  30S ribosomal protein S14  58.43 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0184  30S ribosomal protein S14  57.3 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.282468 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19170  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.205421  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3721  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  100  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2051  30S ribosomal protein S14  59.55 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000573988  normal  0.404891 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3919  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  100  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0557  ribosomal protein S14  56.18 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.67281  normal  0.167301 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36480  SSU ribosomal protein S14P  49.5 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.833214 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5491  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal  0.0421593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2905  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378522  normal  0.633116 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0605  ribosomal protein S14  50 
 
 		 98 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1310  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0069  ribosomal protein S14  48 
 
 		 100 aa  93.6  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.590343  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3373  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  93.2  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.773446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12093  30S ribosomal protein S14  48.08 
 
 		 101 aa  93.2  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000485433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3293  ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1272  ribosomal protein S14  51.58 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0267  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0687464  normal  0.437866 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2283  30S ribosomal protein S14  51.69 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000126284  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2151  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2188  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.913907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2466  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0285  ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  90.9  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.28128  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0439  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  90.1  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000050629  hitchhiker  0.0000949985 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0194  30S ribosomal protein S14  53.93 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.482071  normal  0.975844 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2853  30S ribosomal protein S14  43.56 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544731  normal  0.525302 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00951  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  89.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288651  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2216  30S ribosomal protein S14  52.81 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050188  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0374  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1728  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133378  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2521  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0604  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001729  SSU ribosomal protein S14p (S29e)  49.5 
 
 		 101 aa  88.6  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000996787  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2606  30S ribosomal protein S14  56.18 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0226  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  88.2  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000624437  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1627  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  88.2  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.284019 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00743  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  87.8  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0567  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  87.8  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1838  30S ribosomal protein S14  52.81 
 
 		 89 aa  87  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247662  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1466  ribosomal protein S14  44.55 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170375  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1002  ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  86.7  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000566034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4043  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000318217  unclonable  0.00000000000274518 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0209  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434806  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0298  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0333  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0213  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000765112  unclonable  0.00000853869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4157  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000237704  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3982  ribosomal protein S14  52.63 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0073  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0161  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000142165  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0772  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51274  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3696  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00964578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3623  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00146543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3794  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0197  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337637  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3731  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0634763  normal  0.0239339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3623  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000455836  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2410  30S ribosomal protein S14  50.56 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00120885  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0161  ribosomal protein S14  41.58 
 
 		 101 aa  84.7  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400733 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0244  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0502  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000100367  hitchhiker  0.00403438 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0171  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  decreased coverage  0.0000502877 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4304  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000890195  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0497  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000674394  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3746  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000320065  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0212  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000559885  unclonable  0.0000000000128265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0207  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000156094  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0212  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000604107  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1367  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.733722  normal  0.0818986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2205  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4677  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000132516  unclonable  0.00000000984925 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3738  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  84  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000436001  decreased coverage  0.00101243 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2161  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  84  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000755584  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0308  ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  83.6  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000208826  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3988  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  83.6  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168121  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3809  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  83.6  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000276369  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03158  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000309801  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0406  ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000311581  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3501  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690284  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3790  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683698  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3692  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000389079  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03109  hypothetical protein  47.52 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000139286  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0406  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000372668  hitchhiker  0.0000137856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>