More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0285 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0285  ribosomal protein S14  100 
 
 
101 aa  197  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.28128  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19170  30S ribosomal protein S14  71.29 
 
 
101 aa  149  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.205421  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3721  30S ribosomal protein S14  68.32 
 
 
101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3919  30S ribosomal protein S14  66.34 
 
 
101 aa  140  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5491  30S ribosomal protein S14  67.33 
 
 
101 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal  0.0421593 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0161  ribosomal protein S14  67.33 
 
 
101 aa  130  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00400733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1310  30S ribosomal protein S14  67.33 
 
 
101 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0605  ribosomal protein S14  68.32 
 
 
98 aa  127  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36480  SSU ribosomal protein S14P  67.33 
 
 
101 aa  127  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.833214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3293  ribosomal protein S14  69.31 
 
 
101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1466  ribosomal protein S14  64.36 
 
 
101 aa  124  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170375  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12093  30S ribosomal protein S14  61.39 
 
 
101 aa  123  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000485433  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5057  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 
101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0176804  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3936  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  114  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0488  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  110  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000639761  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3304  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00814384  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2853  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544731  normal  0.525302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3373  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.773446  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3006  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239301  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4230  30S ribosomal protein S14  55.79 
 
 
98 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0333  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000766053  hitchhiker  0.000426271 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2312  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  108  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00369177  normal  0.384073 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0069  ribosomal protein S14  56.73 
 
 
100 aa  107  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.590343  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0332  SSU ribosomal protein S14P  50.5 
 
 
101 aa  107  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.84975e-18  unclonable  0.0000000474236 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1937  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000295863  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2619  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00326557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3733  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000471214  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3491  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0297589  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3763  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000751024  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3055  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  107  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000566724  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3791  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0910984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3156  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000867559  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2937  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000210491  hitchhiker  0.000000785932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3284  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000159441  hitchhiker  0.00000214685 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0340  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119907  normal  0.0120704 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0289  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000215365  normal  0.0115353 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2746  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000874703  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0280  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000109456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0361  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000769371  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2826  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591493  normal  0.456449 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0262  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000389455  hitchhiker  0.00180816 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3460  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000254777  decreased coverage  0.00448614 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0327  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000923882  decreased coverage  0.00287275 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0066  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  106  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185817  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0063  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  106  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000147602  hitchhiker  8.43834e-17 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3631  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000617714  decreased coverage  0.00000000000127186 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3166  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  104  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000693481  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3325  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  104  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000022678  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0418  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  103  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000392658  normal  0.228151 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0073  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  103  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0502  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000100367  hitchhiker  0.00403438 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0434  SSU ribosomal protein S14P  52.48 
 
 
101 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0108067  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0497  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000674394  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1340  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843719  normal  0.149539 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3430  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.243103  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2161  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000755584  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3511  ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  101  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000387623  hitchhiker  0.0000000964765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2905  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  100  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378522  normal  0.633116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1921  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  100  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1035  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  100  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352653  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0614  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  100  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255851  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0732  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  100  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0027936  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001729  SSU ribosomal protein S14p (S29e)  53.47 
 
 
101 aa  100  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000996787  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0394  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000622338  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03158  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000309801  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0406  ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000311581  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0406  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000372668  hitchhiker  0.0000137856 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3790  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683698  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3501  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690284  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00951  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288651  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3692  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000389079  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0439  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  99.4  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000050629  hitchhiker  0.0000949985 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1002  ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  99.4  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000566034  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03109  hypothetical protein  53.47 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000139286  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3602  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000121429  normal  0.0164764 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4630  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000273788  normal  0.541186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0386  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000402264  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0780  ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  98.6  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000315773  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1262  30S ribosomal protein S14  57.43 
 
 
101 aa  99  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.536086  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00743  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  99.4  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0999  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0161661 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2805  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  99  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539681  normal  0.449731 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0340  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0471  SSU ribosomal protein S14P  50.5 
 
 
101 aa  98.2  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0418  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  98.2  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000405009  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0292  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  97.8  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000253774  hitchhiker  0.00000211438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0213  ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  97.4  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3901  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  97.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000036501  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0296  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  97.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000386262  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0596  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  97.8  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000010236  normal  0.493148 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0333  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  97.4  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3270  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
100 aa  97.4  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0411187  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0446  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
100 aa  97.1  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1367  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  97.1  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.733722  normal  0.0818986 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3731  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0634763  normal  0.0239339 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1854  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371394  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3623  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000455836  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3794  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3738  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  96.3  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000436001  decreased coverage  0.00101243 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3696  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00964578  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>