More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3293 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3293  ribosomal protein S14  100 
 
 
101 aa  199  9e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5491  30S ribosomal protein S14  71.29 
 
 
101 aa  149  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal  0.0421593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1310  30S ribosomal protein S14  73.27 
 
 
101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12093  30S ribosomal protein S14  67.33 
 
 
101 aa  136  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000485433  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36480  SSU ribosomal protein S14P  66.34 
 
 
101 aa  135  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.833214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0285  ribosomal protein S14  69.31 
 
 
101 aa  134  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.28128  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2853  30S ribosomal protein S14  66.34 
 
 
101 aa  131  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544731  normal  0.525302 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19170  30S ribosomal protein S14  61.39 
 
 
101 aa  127  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.205421  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0605  ribosomal protein S14  63.37 
 
 
98 aa  122  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2905  30S ribosomal protein S14  62.38 
 
 
101 aa  122  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378522  normal  0.633116 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3919  30S ribosomal protein S14  57.43 
 
 
101 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3373  30S ribosomal protein S14  59.41 
 
 
101 aa  118  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.773446  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3721  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  117  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0161  ribosomal protein S14  60.4 
 
 
101 aa  117  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00400733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1466  ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170375  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0069  ribosomal protein S14  55.45 
 
 
100 aa  106  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.590343  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4043  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000318217  unclonable  0.00000000000274518 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0209  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434806  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0197  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  102  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337637  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0213  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000765112  unclonable  0.00000853869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4157  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000237704  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2311  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170574  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0212  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000559885  unclonable  0.0000000000128265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0207  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000156094  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0226  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000624437  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0244  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0212  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000604107  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3746  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  101  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000320065  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0161  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  101  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000142165  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0171  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  100  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  decreased coverage  0.0000502877 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4677  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  100  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000132516  unclonable  0.00000000984925 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2156  ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.11906  normal  0.323543 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001729  SSU ribosomal protein S14p (S29e)  48.51 
 
 
101 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000996787  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00743  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0183  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  99.4  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000146955  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4304  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000890195  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3896  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000012312  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1360  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
89 aa  99  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0213  ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  98.2  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1077  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271481  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2161  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  98.2  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000755584  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00951  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  97.8  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288651  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2359  ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  97.1  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0614  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  97.1  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0073  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  97.1  8e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0333  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0332  SSU ribosomal protein S14P  46.53 
 
 
101 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.84975e-18  unclonable  0.0000000474236 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0418  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  96.3  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000392658  normal  0.228151 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2805  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  96.3  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539681  normal  0.449731 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0732  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0027936  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1969  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000314461  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0336  ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  95.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442149  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3936  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  95.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1854  30S ribosomal protein S14  44.55 
 
 
101 aa  94.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371394  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1220  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1183  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.552598  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06380  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000466931  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1340  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  94  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843719  normal  0.149539 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3304  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  94  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00814384  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1754  30S ribosomal protein S14  43.56 
 
 
89 aa  94  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00383016  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0439  30S ribosomal protein S14  44.55 
 
 
101 aa  93.6  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000050629  hitchhiker  0.0000949985 
 
 
-
 
NC_002978  WD0668  30S ribosomal protein S14  46.08 
 
 
102 aa  92.8  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.549437  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2826  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591493  normal  0.456449 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3631  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000617714  decreased coverage  0.00000000000127186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0327  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000923882  decreased coverage  0.00287275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2151  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1002  ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000566034  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0999  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0161661 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3982  ribosomal protein S14  46.53 
 
 
95 aa  92.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3006  30S ribosomal protein S14  43.56 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239301  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0168  ribosomal protein S14  46.53 
 
 
85 aa  92.8  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000187537  hitchhiker  3.50786e-17 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3491  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0297589  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2619  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00326557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3733  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000471214  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3763  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000751024  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1838  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247662  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0850  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
115 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0567649  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3055  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000566724  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3156  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000867559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3791  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0910984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08980  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00144402  normal  0.0937725 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1937  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000295863  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2216  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050188  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2466  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18853  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2188  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.913907  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3284  30S ribosomal protein S14  43.56 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000159441  hitchhiker  0.00000214685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2937  30S ribosomal protein S14  43.56 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000210491  hitchhiker  0.000000785932 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2051  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
89 aa  91.3  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000573988  normal  0.404891 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0905  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
89 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0567  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  91.3  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3270  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
100 aa  91.3  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0411187  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2205  30S ribosomal protein S14  44.55 
 
 
101 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404877  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0604  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  90.9  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.472799  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5057  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  90.9  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0176804  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0599  30S ribosomal protein S14  44.55 
 
 
101 aa  90.5  7e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.118068  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0267  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  90.5  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0687464  normal  0.437866 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0422  30S ribosomal protein S14  44.55 
 
 
101 aa  90.5  8e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0502  30S ribosomal protein S14  43.56 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000100367  hitchhiker  0.00403438 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0262  30S ribosomal protein S14  44.55 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000389455  hitchhiker  0.00180816 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0497  30S ribosomal protein S14  43.56 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000674394  normal  0.0635916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>