More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1628 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1628  ribosomal protein S14  100 
 
 
89 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5774  ribosomal protein S14  71.91 
 
 
89 aa  140  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0491474  normal  0.403708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0615  ribosomal protein S14  74.16 
 
 
89 aa  140  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4356  ribosomal protein S14  69.66 
 
 
89 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629115  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_002950  PG1925  30S ribosomal protein S14  71.91 
 
 
89 aa  133  7.000000000000001e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3149  SSU ribosomal protein S14P  69.66 
 
 
89 aa  131  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.457334  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05785  ribosomal protein S14  66.29 
 
 
89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1160  30S ribosomal protein S14  67.42 
 
 
89 aa  127  7.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204573  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0384  30S ribosomal protein S14  64.04 
 
 
89 aa  121  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0184  30S ribosomal protein S14  64.04 
 
 
89 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.282468 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0855  ribosomal protein S14  62.92 
 
 
89 aa  117  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1360  30S ribosomal protein S14  61.8 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2051  30S ribosomal protein S14  59.55 
 
 
89 aa  110  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000573988  normal  0.404891 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1077  30S ribosomal protein S14  59.55 
 
 
89 aa  106  9.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271481  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1838  30S ribosomal protein S14  56.18 
 
 
89 aa  103  8e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247662  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2283  30S ribosomal protein S14  53.93 
 
 
89 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000126284  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0439  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  101  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000050629  hitchhiker  0.0000949985 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0194  30S ribosomal protein S14  55.06 
 
 
89 aa  101  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.482071  normal  0.975844 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0502  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  100  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000100367  hitchhiker  0.00403438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0497  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  100  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000674394  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3430  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  100  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.243103  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00951  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  100  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288651  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2216  30S ribosomal protein S14  52.81 
 
 
89 aa  100  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050188  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0905  30S ribosomal protein S14  52.81 
 
 
89 aa  99  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1424  30S ribosomal protein S14  52.81 
 
 
89 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000838917  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1397  30S ribosomal protein S14  52.81 
 
 
89 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000161259  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3006  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  98.6  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239301  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3311  30S ribosomal protein S14  50 
 
 
100 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0302  30S ribosomal protein S14  53.93 
 
 
89 aa  98.2  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0308  ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  97.4  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000208826  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0488  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  96.7  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000639761  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0332  SSU ribosomal protein S14P  50.5 
 
 
101 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.84975e-18  unclonable  0.0000000474236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3166  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000693481  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2937  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000210491  hitchhiker  0.000000785932 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0340  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119907  normal  0.0120704 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0262  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000389455  hitchhiker  0.00180816 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0289  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000215365  normal  0.0115353 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3460  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000254777  decreased coverage  0.00448614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3284  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000159441  hitchhiker  0.00000214685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2746  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000874703  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0280  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000109456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0361  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000769371  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3511  ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  95.1  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000387623  hitchhiker  0.0000000964765 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001729  SSU ribosomal protein S14p (S29e)  52.48 
 
 
101 aa  95.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000996787  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3304  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00814384  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0226  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000624437  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1754  30S ribosomal protein S14  50.56 
 
 
89 aa  94  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00383016  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0557  ribosomal protein S14  52.81 
 
 
89 aa  94  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.67281  normal  0.167301 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2410  30S ribosomal protein S14  49.44 
 
 
89 aa  94  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00120885  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00743  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  94  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0298  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  93.6  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0446  30S ribosomal protein S14  47 
 
 
100 aa  93.6  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0333  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  93.6  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000766053  hitchhiker  0.000426271 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1272  ribosomal protein S14  49.47 
 
 
95 aa  92.8  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3631  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000617714  decreased coverage  0.00000000000127186 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2826  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591493  normal  0.456449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0327  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000923882  decreased coverage  0.00287275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1002  ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000566034  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0471  SSU ribosomal protein S14P  48.51 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0333  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3325  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000022678  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5057  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  92  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0176804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2619  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00326557  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0418  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000392658  normal  0.228151 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3763  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000751024  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3491  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0297589  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3055  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000566724  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3156  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000867559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3791  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0910984  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2822  ribosomal protein S14  47 
 
 
100 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00224384 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3733  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000471214  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1937  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000295863  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3270  30S ribosomal protein S14  46 
 
 
100 aa  91.3  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0411187  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4304  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  90.9  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000890195  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4677  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  90.9  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000132516  unclonable  0.00000000984925 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2161  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  90.9  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000755584  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0850  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
115 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0567649  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0212  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000559885  unclonable  0.0000000000128265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0207  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000156094  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3936  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  90.5  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0197  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  90.5  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337637  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0497  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199716  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4736  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000804532  normal  0.483831 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0604  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  90.5  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.472799  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08980  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00144402  normal  0.0937725 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0212  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000604107  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0467  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00078968  hitchhiker  0.00000305269 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0614  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1588  30S ribosomal protein S14  49 
 
 
100 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0500  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000825135  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1613  30S ribosomal protein S14  49 
 
 
100 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06380  30S ribosomal protein S14  50 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000466931  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0780  ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  89.4  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000315773  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2156  ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.11906  normal  0.323543 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0732  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  89.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0027936  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0244  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3746  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000320065  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0066  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  88.2  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185817  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4157  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000237704  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0209  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>