More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0384 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0384  30S ribosomal protein S14  100 
 
 		 89 aa  183  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1160  30S ribosomal protein S14  86.52 
 
 		 89 aa  159  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204573  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05785  ribosomal protein S14  84.27 
 
 		 89 aa  158  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1925  30S ribosomal protein S14  79.78 
 
 		 89 aa  148  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5774  ribosomal protein S14  79.78 
 
 		 89 aa  145  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0491474  normal  0.403708 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3149  SSU ribosomal protein S14P  76.4 
 
 		 89 aa  143  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.457334  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0615  ribosomal protein S14  76.4 
 
 		 89 aa  141  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4356  ribosomal protein S14  69.66 
 
 		 89 aa  134  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629115  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0855  ribosomal protein S14  69.66 
 
 		 89 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0184  30S ribosomal protein S14  67.42 
 
 		 89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.282468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1628  ribosomal protein S14  64.04 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1360  30S ribosomal protein S14  60.67 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1424  30S ribosomal protein S14  59.55 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000838917  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1397  30S ribosomal protein S14  59.55 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000161259  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0905  30S ribosomal protein S14  58.43 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1077  30S ribosomal protein S14  58.43 
 
 		 89 aa  108  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271481  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3982  ribosomal protein S14  56.84 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5057  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 		 101 aa  104  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0176804  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1272  ribosomal protein S14  54.74 
 
 		 95 aa  103  7e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3270  30S ribosomal protein S14  55 
 
 		 100 aa  103  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0411187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0439  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 		 101 aa  103  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000050629  hitchhiker  0.0000949985 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00951  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 		 101 aa  103  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288651  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0557  ribosomal protein S14  55.06 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.67281  normal  0.167301 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2216  30S ribosomal protein S14  57.3 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050188  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0502  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000100367  hitchhiker  0.00403438 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0194  30S ribosomal protein S14  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.482071  normal  0.975844 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0497  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000674394  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1754  30S ribosomal protein S14  53.93 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00383016  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3511  ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  100  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000387623  hitchhiker  0.0000000964765 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1002  ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  100  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000566034  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3311  30S ribosomal protein S14  54 
 
 		 100 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2051  30S ribosomal protein S14  57.3 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000573988  normal  0.404891 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1588  30S ribosomal protein S14  56 
 
 		 100 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0614  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1613  30S ribosomal protein S14  56 
 
 		 100 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1838  30S ribosomal protein S14  53.93 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247662  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2822  ribosomal protein S14  53 
 
 		 100 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00224384 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2312  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 		 101 aa  98.2  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00369177  normal  0.384073 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0302  30S ribosomal protein S14  56.18 
 
 		 89 aa  98.2  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0604  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  97.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0267  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0687464  normal  0.437866 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001729  SSU ribosomal protein S14p (S29e)  50.5 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000996787  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2410  30S ribosomal protein S14  51.69 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00120885  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00743  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0446  30S ribosomal protein S14  50 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4677  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000132516  unclonable  0.00000000984925 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3430  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.243103  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0333  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2283  30S ribosomal protein S14  51.69 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000126284  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0850  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 115 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0567649  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3006  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239301  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0308  ribosomal protein S14  50.49 
 
 		 101 aa  94  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000208826  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0471  SSU ribosomal protein S14P  51.49 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3746  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000320065  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08980  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00144402  normal  0.0937725 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0073  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  93.6  8e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3919  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  93.6  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0332  SSU ribosomal protein S14P  52.48 
 
 		 101 aa  93.2  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.84975e-18  unclonable  0.0000000474236 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03158  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000309801  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0406  ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000311581  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4630  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000273788  normal  0.541186 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0418  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000405009  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0209  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434806  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4043  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000318217  unclonable  0.00000000000274518 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2937  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000210491  hitchhiker  0.000000785932 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0406  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000372668  hitchhiker  0.0000137856 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3602  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000121429  normal  0.0164764 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3284  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000159441  hitchhiker  0.00000214685 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0213  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000765112  unclonable  0.00000853869 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3790  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683698  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4263  ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526043  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4157  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000237704  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0171  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  decreased coverage  0.0000502877 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03109  hypothetical protein  50.5 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000139286  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0333  30S ribosomal protein S14  48.54 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000766053  hitchhiker  0.000426271 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0161  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000142165  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3692  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000389079  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0298  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0226  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000624437  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3501  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690284  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0170  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0625334  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1732  30S ribosomal protein S14  50 
 
 		 100 aa  92  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0197  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337637  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1291  30S ribosomal protein S14  50 
 
 		 100 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13831  30S ribosomal protein S14  51 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4304  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  92.8  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000890195  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0732  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0027936  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0066  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 		 101 aa  92  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185817  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0488  30S ribosomal protein S14  48.04 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000639761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0212  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000604107  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3901  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000036501  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0244  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0596  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000010236  normal  0.493148 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19170  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.205421  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0296  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000386262  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0212  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000559885  unclonable  0.0000000000128265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0207  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000156094  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1030  SSU ribosomal protein S14P  58.43 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000126459  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13911  30S ribosomal protein S14  50 
 
 		 100 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0809  30S ribosomal protein S14  48 
 
 		 100 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.815003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>