More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5774 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5774  ribosomal protein S14  100 
 
 		 89 aa  181  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0491474  normal  0.403708 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4356  ribosomal protein S14  82.02 
 
 		 89 aa  159  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629115  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3149  SSU ribosomal protein S14P  80.9 
 
 		 89 aa  157  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.457334  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0615  ribosomal protein S14  83.15 
 
 		 89 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0384  30S ribosomal protein S14  79.78 
 
 		 89 aa  145  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05785  ribosomal protein S14  77.53 
 
 		 89 aa  145  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1925  30S ribosomal protein S14  76.4 
 
 		 89 aa  142  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0184  30S ribosomal protein S14  74.16 
 
 		 89 aa  141  3e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.282468 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1160  30S ribosomal protein S14  76.4 
 
 		 89 aa  140  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204573  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1628  ribosomal protein S14  71.91 
 
 		 89 aa  140  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0855  ribosomal protein S14  73.03 
 
 		 89 aa  134  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1360  30S ribosomal protein S14  68.54 
 
 		 89 aa  126  8.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1077  30S ribosomal protein S14  65.17 
 
 		 89 aa  120  9e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271481  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1424  30S ribosomal protein S14  61.8 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000838917  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1397  30S ribosomal protein S14  61.8 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000161259  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0905  30S ribosomal protein S14  59.55 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2051  30S ribosomal protein S14  61.8 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000573988  normal  0.404891 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0557  ribosomal protein S14  56.18 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.67281  normal  0.167301 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0439  30S ribosomal protein S14  57.43 
 
 		 101 aa  104  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000050629  hitchhiker  0.0000949985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5057  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0176804  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00951  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 		 101 aa  103  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288651  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2312  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 		 101 aa  103  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00369177  normal  0.384073 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0298  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  102  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2283  30S ribosomal protein S14  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000126284  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0604  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1002  ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000566034  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0267  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0687464  normal  0.437866 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2216  30S ribosomal protein S14  58.43 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050188  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0732  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  100  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0027936  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0194  30S ribosomal protein S14  57.3 
 
 		 89 aa  100  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.482071  normal  0.975844 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1272  ribosomal protein S14  53.68 
 
 		 95 aa  100  7e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0502  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 		 101 aa  100  8e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000100367  hitchhiker  0.00403438 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0308  ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  100  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000208826  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0497  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 		 101 aa  100  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000674394  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1754  30S ribosomal protein S14  53.93 
 
 		 89 aa  100  9e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00383016  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0170  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  99.4  1e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0625334  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3430  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.243103  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0333  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000766053  hitchhiker  0.000426271 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0332  SSU ribosomal protein S14P  51.49 
 
 		 101 aa  98.6  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.84975e-18  unclonable  0.0000000474236 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0213  ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3304  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  98.2  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00814384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0772  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  98.2  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51274  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3006  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  98.2  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239301  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0302  30S ribosomal protein S14  57.3 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1838  30S ribosomal protein S14  56.18 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001729  SSU ribosomal protein S14p (S29e)  51.49 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000996787  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0488  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000639761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0418  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  97.8  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000392658  normal  0.228151 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0226  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  97.4  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000624437  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0850  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 115 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0567649  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08980  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00144402  normal  0.0937725 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3919  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  97.1  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3511  ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  97.1  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000387623  hitchhiker  0.0000000964765 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03158  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000309801  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0406  ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000311581  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3602  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000121429  normal  0.0164764 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1728  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133378  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3501  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690284  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3284  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000159441  hitchhiker  0.00000214685 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03109  hypothetical protein  52.48 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000139286  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3790  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683698  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3692  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000389079  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0374  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2521  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2937  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000210491  hitchhiker  0.000000785932 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0406  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000372668  hitchhiker  0.0000137856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4630  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000273788  normal  0.541186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0614  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00743  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3311  30S ribosomal protein S14  50.49 
 
 		 100 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0471  SSU ribosomal protein S14P  50.5 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3166  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000693481  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4157  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000237704  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4043  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000318217  unclonable  0.00000000000274518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4230  30S ribosomal protein S14  52.69 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0213  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000765112  unclonable  0.00000853869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0209  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434806  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3936  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0066  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185817  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3721  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1588  30S ribosomal protein S14  53 
 
 		 100 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2822  ribosomal protein S14  51 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00224384 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1613  30S ribosomal protein S14  53 
 
 		 100 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3631  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000617714  decreased coverage  0.00000000000127186 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3746  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000320065  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0327  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000923882  decreased coverage  0.00287275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0197  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337637  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0244  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0333  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3696  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00964578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3794  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3731  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0634763  normal  0.0239339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3623  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000455836  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3623  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00146543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3270  30S ribosomal protein S14  50 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0411187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0212  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000559885  unclonable  0.0000000000128265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0207  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000156094  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0212  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000604107  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0289  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000215365  normal  0.0115353 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0361  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000769371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>