More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2905 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2905  30S ribosomal protein S14  100 
 
 
101 aa  190  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378522  normal  0.633116 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2853  30S ribosomal protein S14  85.15 
 
 
101 aa  166  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544731  normal  0.525302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3373  30S ribosomal protein S14  67.33 
 
 
101 aa  131  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.773446  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19170  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.205421  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36480  SSU ribosomal protein S14P  57.43 
 
 
101 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.833214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3919  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  113  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5491  30S ribosomal protein S14  58.42 
 
 
101 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal  0.0421593 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3293  ribosomal protein S14  62.38 
 
 
101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1310  30S ribosomal protein S14  58.42 
 
 
101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0226  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000624437  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3721  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0614  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00951  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288651  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0605  ribosomal protein S14  60.4 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0732  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0027936  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12093  30S ribosomal protein S14  58.42 
 
 
101 aa  108  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000485433  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1002  ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000566034  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0069  ribosomal protein S14  56.44 
 
 
100 aa  107  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.590343  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0171  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  107  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  decreased coverage  0.0000502877 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0197  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  107  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337637  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0161  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000142165  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0209  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434806  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0213  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000765112  unclonable  0.00000853869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4157  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000237704  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4043  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000318217  unclonable  0.00000000000274518 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4304  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000890195  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0161  ribosomal protein S14  59.41 
 
 
101 aa  105  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00400733 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0212  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000559885  unclonable  0.0000000000128265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0207  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000156094  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1466  ribosomal protein S14  55.45 
 
 
101 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170375  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0183  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  104  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000146955  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0212  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  104  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000604107  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0244  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  103  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3746  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  103  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000320065  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2311  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170574  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4677  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000132516  unclonable  0.00000000984925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3896  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000012312  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2161  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000755584  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0285  ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  100  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.28128  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001729  SSU ribosomal protein S14p (S29e)  48.51 
 
 
101 aa  100  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000996787  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0418  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  100  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000392658  normal  0.228151 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0333  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  100  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00743  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  100  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4263  ribosomal protein S14  50.48 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526043  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0502  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  98.6  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000100367  hitchhiker  0.00403438 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0439  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  99  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000050629  hitchhiker  0.0000949985 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0497  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  98.6  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000674394  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0769  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  98.2  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0657846  normal  0.0117281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0850  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
115 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0567649  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08980  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00144402  normal  0.0937725 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0073  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  97.4  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0446  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  97.4  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0684905  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0507  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  97.4  7e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.245426  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2359  ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  96.7  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0639  ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000000461822  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1077  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
89 aa  96.7  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271481  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06380  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  96.3  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000466931  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3511  ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000387623  hitchhiker  0.0000000964765 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0434  SSU ribosomal protein S14P  47.52 
 
 
101 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0108067  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1360  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03158  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000309801  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0406  ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000311581  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03109  hypothetical protein  47.52 
 
 
101 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000139286  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3602  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000121429  normal  0.0164764 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3501  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690284  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4630  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000273788  normal  0.541186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3692  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000389079  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0406  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000372668  hitchhiker  0.0000137856 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3790  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683698  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0213  ribosomal protein S14  42.57 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4535  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0668255  normal  0.120903 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0336  ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  94  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442149  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0332  SSU ribosomal protein S14P  47.52 
 
 
101 aa  93.6  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.84975e-18  unclonable  0.0000000474236 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3006  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239301  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0615  ribosomal protein S14  47.52 
 
 
89 aa  93.2  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3901  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000036501  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0418  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000405009  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0308  ribosomal protein S14  43.56 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000208826  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3304  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00814384  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0296  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000386262  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0596  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000010236  normal  0.493148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3731  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0634763  normal  0.0239339 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3696  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00964578  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3623  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000455836  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3623  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00146543  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0292  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000253774  hitchhiker  0.00000211438 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0341  ribosomal protein S14p  43.56 
 
 
101 aa  92  2e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.792662  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3794  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3284  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000159441  hitchhiker  0.00000214685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2937  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000210491  hitchhiker  0.000000785932 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0336  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00010429  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5774  ribosomal protein S14  48.51 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0491474  normal  0.403708 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2156  ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.11906  normal  0.323543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5066  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000167621  normal  0.114431 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3738  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  91.3  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000436001  decreased coverage  0.00101243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0497  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199716  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05785  ribosomal protein S14  47.52 
 
 
89 aa  90.5  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4736  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000804532  normal  0.483831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0467  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00078968  hitchhiker  0.00000305269 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0066  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  89.4  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>