More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3149 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3149  SSU ribosomal protein S14P  100 
 
 		 89 aa  181  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.457334  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5774  ribosomal protein S14  80.9 
 
 		 89 aa  157  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0491474  normal  0.403708 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4356  ribosomal protein S14  78.65 
 
 		 89 aa  153  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629115  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0184  30S ribosomal protein S14  77.53 
 
 		 89 aa  144  3e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.282468 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0384  30S ribosomal protein S14  76.4 
 
 		 89 aa  143  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05785  ribosomal protein S14  73.03 
 
 		 89 aa  141  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1160  30S ribosomal protein S14  74.16 
 
 		 89 aa  138  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204573  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0615  ribosomal protein S14  73.03 
 
 		 89 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1628  ribosomal protein S14  69.66 
 
 		 89 aa  131  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1925  30S ribosomal protein S14  66.29 
 
 		 89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0855  ribosomal protein S14  64.04 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1077  30S ribosomal protein S14  58.43 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271481  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1360  30S ribosomal protein S14  57.3 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2051  30S ribosomal protein S14  60.67 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000573988  normal  0.404891 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0557  ribosomal protein S14  53.93 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.67281  normal  0.167301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0471  SSU ribosomal protein S14P  53.47 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0905  30S ribosomal protein S14  53.93 
 
 		 89 aa  102  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1754  30S ribosomal protein S14  53.93 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00383016  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1424  30S ribosomal protein S14  53.93 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000838917  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1397  30S ribosomal protein S14  53.93 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000161259  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2283  30S ribosomal protein S14  55.06 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000126284  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0194  30S ribosomal protein S14  57.3 
 
 		 89 aa  100  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.482071  normal  0.975844 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2216  30S ribosomal protein S14  53.93 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050188  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3982  ribosomal protein S14  53.68 
 
 		 95 aa  97.1  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1272  ribosomal protein S14  49.47 
 
 		 95 aa  97.1  8e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3919  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5057  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  94.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0176804  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0267  30S ribosomal protein S14  44.55 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0687464  normal  0.437866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3721  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  93.6  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0298  30S ribosomal protein S14  44.55 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2410  30S ribosomal protein S14  50.56 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00120885  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0170  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0625334  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0308  ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000208826  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1613  30S ribosomal protein S14  50 
 
 		 100 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0604  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1588  30S ribosomal protein S14  50 
 
 		 100 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1030  SSU ribosomal protein S14P  58.43 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000126459  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0063  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  90.5  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000147602  hitchhiker  8.43834e-17 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1728  30S ribosomal protein S14  43.56 
 
 		 101 aa  90.5  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133378  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00951  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  90.5  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288651  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2521  30S ribosomal protein S14  43.56 
 
 		 101 aa  90.5  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0374  30S ribosomal protein S14  43.56 
 
 		 101 aa  90.5  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0066  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  90.5  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185817  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0772  30S ribosomal protein S14  43.56 
 
 		 101 aa  90.5  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51274  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0502  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000100367  hitchhiker  0.00403438 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0418  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000392658  normal  0.228151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0497  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000674394  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3311  30S ribosomal protein S14  45 
 
 		 100 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3430  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.243103  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1838  30S ribosomal protein S14  50.56 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247662  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0446  30S ribosomal protein S14  45 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3270  30S ribosomal protein S14  45 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0411187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0850  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 115 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0567649  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08980  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00144402  normal  0.0937725 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0262  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  88.2  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000389455  hitchhiker  0.00180816 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0302  30S ribosomal protein S14  50.56 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0332  SSU ribosomal protein S14P  47.52 
 
 		 101 aa  88.6  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.84975e-18  unclonable  0.0000000474236 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0340  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119907  normal  0.0120704 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0289  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000215365  normal  0.0115353 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2746  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000874703  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0280  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000109456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0361  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000769371  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3460  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  87.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000254777  decreased coverage  0.00448614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1002  ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  87.8  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000566034  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3511  ribosomal protein S14  44.55 
 
 		 101 aa  87.4  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000387623  hitchhiker  0.0000000964765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0340  30S ribosomal protein S14  43.56 
 
 		 101 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03158  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000309801  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0406  ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000311581  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3602  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000121429  normal  0.0164764 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3692  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000389079  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03109  hypothetical protein  45.54 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000139286  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3501  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690284  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4630  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000273788  normal  0.541186 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0406  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000372668  hitchhiker  0.0000137856 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3790  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683698  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3738  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000436001  decreased coverage  0.00101243 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0439  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000050629  hitchhiker  0.0000949985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4736  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000804532  normal  0.483831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2205  30S ribosomal protein S14  44.55 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0497  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0467  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00078968  hitchhiker  0.00000305269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3325  30S ribosomal protein S14  44.55 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000022678  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5066  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000167621  normal  0.114431 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2606  30S ribosomal protein S14  52.81 
 
 		 89 aa  85.9  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2312  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00369177  normal  0.384073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0292  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000253774  hitchhiker  0.00000211438 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001729  SSU ribosomal protein S14p (S29e)  45.54 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000996787  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0213  ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0333  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000766053  hitchhiker  0.000426271 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19170  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.205421  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0500  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000825135  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0732  30S ribosomal protein S14  43.56 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0027936  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0333  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  84.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3006  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239301  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3166  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000693481  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0972  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000120415  hitchhiker  0.000000929871 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0226  30S ribosomal protein S14  44.55 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000624437  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12093  30S ribosomal protein S14  43.56 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000485433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0845  ribosomal protein S14  43.56 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3623  30S ribosomal protein S14  44.55 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00146543  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>