More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0557 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0557  ribosomal protein S14  100 
 
 		 89 aa  180  4.0000000000000006e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.67281  normal  0.167301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0855  ribosomal protein S14  59.55 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0905  30S ribosomal protein S14  57.3 
 
 		 89 aa  107  8.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5774  ribosomal protein S14  56.18 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0491474  normal  0.403708 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1397  30S ribosomal protein S14  57.3 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000161259  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1424  30S ribosomal protein S14  57.3 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000838917  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4356  ribosomal protein S14  55.06 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629115  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_002950  PG1925  30S ribosomal protein S14  55.06 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0384  30S ribosomal protein S14  55.06 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3149  SSU ribosomal protein S14P  53.93 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.457334  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05785  ribosomal protein S14  51.69 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1077  30S ribosomal protein S14  56.18 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271481  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1360  30S ribosomal protein S14  52.81 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0184  30S ribosomal protein S14  53.93 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.282468 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1754  30S ribosomal protein S14  50.56 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00383016  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1160  30S ribosomal protein S14  49.44 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204573  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1628  ribosomal protein S14  52.81 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0615  ribosomal protein S14  51.69 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1272  ribosomal protein S14  50.53 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1367  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.733722  normal  0.0818986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1921  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2606  30S ribosomal protein S14  55.06 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2051  30S ribosomal protein S14  51.69 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000573988  normal  0.404891 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3982  ribosomal protein S14  49.47 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1340  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  87.4  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843719  normal  0.149539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0605  ribosomal protein S14  52.04 
 
 		 98 aa  87.8  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0567  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  87  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1838  30S ribosomal protein S14  49.44 
 
 		 89 aa  87  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247662  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1782  SSU ribosomal protein S14P  48.51 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0484502  normal  0.0815843 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2521  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1728  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133378  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0374  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3006  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239301  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2822  ribosomal protein S14  47 
 
 		 100 aa  84.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00224384 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3270  30S ribosomal protein S14  45 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0411187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0285  ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  84.3  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.28128  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2937  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000210491  hitchhiker  0.000000785932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3284  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000159441  hitchhiker  0.00000214685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3304  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00814384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0340  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0298  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  83.6  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0194  30S ribosomal protein S14  49.44 
 
 		 89 aa  83.6  9e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.482071  normal  0.975844 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3721  30S ribosomal protein S14  44.55 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0066  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  82.8  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185817  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0302  30S ribosomal protein S14  48.31 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5057  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  82.8  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0176804  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3919  30S ribosomal protein S14  43.56 
 
 		 101 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1588  30S ribosomal protein S14  48 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2312  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00369177  normal  0.384073 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0213  ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19170  30S ribosomal protein S14  44.55 
 
 		 101 aa  82.8  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.205421  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0604  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1613  30S ribosomal protein S14  48 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0267  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0687464  normal  0.437866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1665  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  82.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0077571  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1030  SSU ribosomal protein S14P  55.06 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000126459  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0161  ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400733 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1969  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  82.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000314461  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0063  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000147602  hitchhiker  8.43834e-17 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2619  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00326557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3733  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000471214  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2283  30S ribosomal protein S14  46.07 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000126284  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3763  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000751024  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2216  30S ribosomal protein S14  47.19 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050188  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3791  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0910984  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3055  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000566724  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3491  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0297589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1937  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000295863  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3156  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000867559  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2805  30S ribosomal protein S14  44.55 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539681  normal  0.449731 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2151  30S ribosomal protein S14  44.55 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1854  30S ribosomal protein S14  43.56 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371394  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0772  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51274  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0327  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000923882  decreased coverage  0.00287275 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3631  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000617714  decreased coverage  0.00000000000127186 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1183  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  80.1  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.552598  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1220  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  80.1  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0446  30S ribosomal protein S14  42 
 
 		 100 aa  80.1  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2466  30S ribosomal protein S14  43.56 
 
 		 101 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3166  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000693481  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0418  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  80.1  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000392658  normal  0.228151 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2188  30S ribosomal protein S14  43.56 
 
 		 101 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.913907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5491  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal  0.0421593 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1443  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190853 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1345  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000233986  normal  0.0693599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0972  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000120415  hitchhiker  0.000000929871 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0340  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119907  normal  0.0120704 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3311  30S ribosomal protein S14  41 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2746  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000874703  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0280  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000109456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0361  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000769371  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0289  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000215365  normal  0.0115353 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0069  ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.590343  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0333  30S ribosomal protein S14  42.57 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000766053  hitchhiker  0.000426271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3460  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000254777  decreased coverage  0.00448614 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2826  30S ribosomal protein S14  44.55 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591493  normal  0.456449 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0262  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000389455  hitchhiker  0.00180816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1466  ribosomal protein S14  45.19 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2675  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.141286  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1732  30S ribosomal protein S14  44 
 
 		 100 aa  77.4  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>