26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2935 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2935  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  323  6e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0708  hypothetical protein  41.13 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0143  hypothetical protein  42.36 
 
 		 157 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0012  hypothetical protein  38.73 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0369  hypothetical protein  37.14 
 
 		 156 aa  90.9  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2040  hypothetical protein  45.38 
 
 		 163 aa  90.5  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0938  hypothetical protein  33.88 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1088  hypothetical protein  34.27 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3018  hypothetical protein  34.78 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.755001  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3242  hypothetical protein  40.19 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1123  hypothetical protein  34.23 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6286  hypothetical protein  36.44 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1233  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2934  hypothetical protein  30.88 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3297  hypothetical protein  30.07 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5311  hypothetical protein  30.71 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558577 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1599  hypothetical protein  34.38 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6270  hypothetical protein  38.46 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.481188  normal  0.278724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1774  hypothetical protein  36.54 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1808  hypothetical protein  29.82 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0352824 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4855  hypothetical protein  28.32 
 
 		 189 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457667  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4763  hypothetical protein  30.77 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207751  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4939  hypothetical protein  30 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1061  hypothetical protein  33.58 
 
 		 464 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318763  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0266  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.431881  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4887  hypothetical protein  30.71 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>