17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1599 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1599  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  278  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0938  hypothetical protein  28.06 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2935  hypothetical protein  34.38 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331517  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0708  hypothetical protein  29.41 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2040  hypothetical protein  30.83 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0012  hypothetical protein  30.22 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0369  hypothetical protein  31.4 
 
 
156 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6286  hypothetical protein  32.23 
 
 
168 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1088  hypothetical protein  27.4 
 
 
160 aa  50.1  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4855  hypothetical protein  26.11 
 
 
189 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457667  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1808  hypothetical protein  24.36 
 
 
179 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0352824 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0143  hypothetical protein  26.47 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1123  hypothetical protein  31.93 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1774  hypothetical protein  29.36 
 
 
171 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1233  hypothetical protein  31.93 
 
 
178 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3242  hypothetical protein  27.91 
 
 
177 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6270  hypothetical protein  27.52 
 
 
171 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.481188  normal  0.278724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>