27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4855 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4855  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  380  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457667  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1808  hypothetical protein  88.33 
 
 		 179 aa  323  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0352824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3242  hypothetical protein  50.6 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1774  hypothetical protein  47.4 
 
 		 171 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6270  hypothetical protein  45.98 
 
 		 171 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.481188  normal  0.278724 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1088  hypothetical protein  46.5 
 
 		 160 aa  137  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6286  hypothetical protein  47.2 
 
 		 168 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1233  hypothetical protein  43.98 
 
 		 178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1123  hypothetical protein  42.77 
 
 		 178 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5311  hypothetical protein  36.17 
 
 		 175 aa  92.8  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0143  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  91.3  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0369  hypothetical protein  38.46 
 
 		 156 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0708  hypothetical protein  38.62 
 
 		 157 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3018  hypothetical protein  31.03 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.755001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0012  hypothetical protein  34.87 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2040  hypothetical protein  33.52 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2934  hypothetical protein  28.82 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0938  hypothetical protein  30.49 
 
 		 156 aa  77  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3297  hypothetical protein  36.36 
 
 		 168 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2690  hypothetical protein  38.74 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4763  hypothetical protein  32.48 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207751  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0266  hypothetical protein  29.87 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.431881  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2935  hypothetical protein  28.32 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4939  hypothetical protein  30 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135969 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1599  hypothetical protein  26.11 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4887  hypothetical protein  27.97 
 
 		 152 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1061  hypothetical protein  29.37 
 
 		 464 aa  42  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318763  normal  0.944847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>