23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4887 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4887  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  312  9e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4763  hypothetical protein  83.87 
 
 		 155 aa  262  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207751  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4939  hypothetical protein  69.68 
 
 		 156 aa  215  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135969 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2690  hypothetical protein  46.58 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3297  hypothetical protein  35.51 
 
 		 168 aa  84  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5311  hypothetical protein  27.34 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558577 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1808  hypothetical protein  28.21 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0352824 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2934  hypothetical protein  28.24 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0369  hypothetical protein  28.67 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1088  hypothetical protein  35.44 
 
 		 160 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3018  hypothetical protein  31.25 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.755001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0012  hypothetical protein  29.05 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4855  hypothetical protein  27.97 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457667  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0708  hypothetical protein  30.23 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3242  hypothetical protein  30 
 
 		 177 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1233  hypothetical protein  31.93 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1123  hypothetical protein  30.89 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0143  hypothetical protein  26.9 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6286  hypothetical protein  31.2 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6270  hypothetical protein  25.64 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.481188  normal  0.278724 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2935  hypothetical protein  30.71 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0938  hypothetical protein  25 
 
 		 156 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1774  hypothetical protein  27.59 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>