24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4763 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4763  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  319  7e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207751  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4887  hypothetical protein  83.87 
 
 		 152 aa  262  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4939  hypothetical protein  78.06 
 
 		 156 aa  249  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135969 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2690  hypothetical protein  44.37 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3297  hypothetical protein  33.55 
 
 		 168 aa  72  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5311  hypothetical protein  32.03 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2934  hypothetical protein  27.91 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1808  hypothetical protein  31.9 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0352824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0012  hypothetical protein  30.2 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4855  hypothetical protein  32.48 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457667  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1233  hypothetical protein  34.19 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3018  hypothetical protein  30 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.755001  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6286  hypothetical protein  32.79 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1123  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0369  hypothetical protein  28.67 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2935  hypothetical protein  30.77 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0708  hypothetical protein  29.32 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6270  hypothetical protein  29.41 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.481188  normal  0.278724 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1088  hypothetical protein  36.71 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3890  hypothetical protein  25.32 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.448345  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0143  hypothetical protein  27.27 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1774  hypothetical protein  30.17 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.05 
 
 		 510 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3242  hypothetical protein  27.93 
 
 		 177 aa  40.8  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>