28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0143 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0143  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  311  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0708  hypothetical protein  78.98 
 
 		 157 aa  251  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0369  hypothetical protein  64.29 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0012  hypothetical protein  53.8 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6270  hypothetical protein  47.18 
 
 		 171 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.481188  normal  0.278724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1774  hypothetical protein  45.07 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2935  hypothetical protein  42.36 
 
 		 164 aa  100  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0938  hypothetical protein  42.22 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1808  hypothetical protein  40.13 
 
 		 179 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0352824 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6286  hypothetical protein  42.28 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1088  hypothetical protein  39.73 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4855  hypothetical protein  40 
 
 		 189 aa  91.3  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457667  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2040  hypothetical protein  43.57 
 
 		 163 aa  90.1  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1123  hypothetical protein  40.41 
 
 		 178 aa  84  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1233  hypothetical protein  40.41 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2934  hypothetical protein  28.76 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3242  hypothetical protein  37.97 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5311  hypothetical protein  32.54 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558577 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3018  hypothetical protein  29.34 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.755001  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3297  hypothetical protein  32.45 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2690  hypothetical protein  35.48 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4887  hypothetical protein  26.9 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1599  hypothetical protein  26.47 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1061  hypothetical protein  30.36 
 
 		 464 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318763  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4763  hypothetical protein  27.27 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207751  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4939  hypothetical protein  27.46 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135969 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0266  hypothetical protein  31.29 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.431881  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3890  hypothetical protein  25.95 
 
 		 173 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.448345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>