25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5311 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5311  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  353  5e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558577 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3018  hypothetical protein  40.61 
 
 		 173 aa  139  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.755001  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2934  hypothetical protein  37.2 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3297  hypothetical protein  39.18 
 
 		 168 aa  107  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1808  hypothetical protein  34.81 
 
 		 179 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0352824 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4855  hypothetical protein  36.17 
 
 		 189 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457667  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3242  hypothetical protein  32.69 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1233  hypothetical protein  31.33 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1123  hypothetical protein  32.32 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0708  hypothetical protein  34.62 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0938  hypothetical protein  32 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6270  hypothetical protein  30.91 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.481188  normal  0.278724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0143  hypothetical protein  32.54 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2040  hypothetical protein  31.1 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0012  hypothetical protein  32.48 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1088  hypothetical protein  29.03 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1774  hypothetical protein  30.3 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0369  hypothetical protein  33.55 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6286  hypothetical protein  30.54 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4763  hypothetical protein  32.03 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207751  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2690  hypothetical protein  32.12 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2935  hypothetical protein  30.71 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4939  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4887  hypothetical protein  27.34 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1061  hypothetical protein  33.09 
 
 		 464 aa  50.8  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318763  normal  0.944847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>