26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3018 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3018  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  352  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.755001  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5311  hypothetical protein  40.61 
 
 		 175 aa  139  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2934  hypothetical protein  44.3 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3297  hypothetical protein  36.49 
 
 		 168 aa  104  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1808  hypothetical protein  34.29 
 
 		 179 aa  89  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0352824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3242  hypothetical protein  30 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4855  hypothetical protein  31.03 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457667  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2040  hypothetical protein  29.88 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1233  hypothetical protein  30.36 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1123  hypothetical protein  30.36 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0369  hypothetical protein  29.87 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0708  hypothetical protein  28.74 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1088  hypothetical protein  31.36 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6286  hypothetical protein  29.34 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0143  hypothetical protein  29.34 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2935  hypothetical protein  34.78 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1774  hypothetical protein  27.27 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0938  hypothetical protein  30.49 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0012  hypothetical protein  25.95 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6270  hypothetical protein  27.17 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.481188  normal  0.278724 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2690  hypothetical protein  26.77 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4763  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207751  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4887  hypothetical protein  31.25 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4939  hypothetical protein  28.24 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3890  hypothetical protein  25.62 
 
 		 173 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.448345  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1061  hypothetical protein  27.91 
 
 		 464 aa  42  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318763  normal  0.944847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>