23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4939 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4939  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  321  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4763  hypothetical protein  78.06 
 
 		 155 aa  249  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207751  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4887  hypothetical protein  69.68 
 
 		 152 aa  215  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2690  hypothetical protein  42.38 
 
 		 158 aa  101  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3297  hypothetical protein  31.61 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2934  hypothetical protein  31.39 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0012  hypothetical protein  32.21 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6286  hypothetical protein  33.86 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1088  hypothetical protein  30.77 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5311  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558577 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1808  hypothetical protein  31.93 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0352824 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1123  hypothetical protein  33.06 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1233  hypothetical protein  32.77 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4855  hypothetical protein  30 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457667  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0369  hypothetical protein  26.76 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2935  hypothetical protein  30 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331517  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3018  hypothetical protein  28.24 
 
 		 173 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.755001  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0266  hypothetical protein  36 
 
 		 146 aa  47.4  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.431881  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1774  hypothetical protein  25.95 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0708  hypothetical protein  28.24 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3242  hypothetical protein  28.57 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6270  hypothetical protein  27.59 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.481188  normal  0.278724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0143  hypothetical protein  27.46 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>