24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3297 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3297  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  340  5.999999999999999e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5311  hypothetical protein  39.18 
 
 
175 aa  107  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558577 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3018  hypothetical protein  36.49 
 
 
173 aa  104  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.755001  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2934  hypothetical protein  34.97 
 
 
166 aa  103  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4887  hypothetical protein  35.51 
 
 
152 aa  84  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3242  hypothetical protein  38.6 
 
 
177 aa  74.3  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4763  hypothetical protein  33.55 
 
 
155 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207751  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2690  hypothetical protein  47.44 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1088  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4855  hypothetical protein  36.36 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457667  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4939  hypothetical protein  31.61 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000135969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0708  hypothetical protein  32.48 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0012  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2040  hypothetical protein  27.44 
 
 
163 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1808  hypothetical protein  35.83 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0352824 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6286  hypothetical protein  32.91 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0369  hypothetical protein  31.33 
 
 
156 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2935  hypothetical protein  30.07 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331517  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0143  hypothetical protein  32.45 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1774  hypothetical protein  35.45 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1123  hypothetical protein  35.65 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1233  hypothetical protein  35.09 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0938  hypothetical protein  25.17 
 
 
156 aa  52  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6270  hypothetical protein  33.64 
 
 
171 aa  51.2  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.481188  normal  0.278724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>