27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0012 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0012  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  321  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0708  hypothetical protein  55.13 
 
 		 157 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0369  hypothetical protein  54.49 
 
 		 156 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0143  hypothetical protein  53.8 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6270  hypothetical protein  44.6 
 
 		 171 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.481188  normal  0.278724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1774  hypothetical protein  43.17 
 
 		 171 aa  104  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2935  hypothetical protein  38.73 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0938  hypothetical protein  37.41 
 
 		 156 aa  98.2  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1233  hypothetical protein  39.58 
 
 		 178 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2040  hypothetical protein  40.88 
 
 		 163 aa  91.7  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1088  hypothetical protein  35.81 
 
 		 160 aa  90.9  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6286  hypothetical protein  41.5 
 
 		 168 aa  90.9  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1123  hypothetical protein  38.89 
 
 		 178 aa  90.9  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3242  hypothetical protein  41.38 
 
 		 177 aa  90.5  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1808  hypothetical protein  34.64 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0352824 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4855  hypothetical protein  34.87 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457667  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5311  hypothetical protein  32.48 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2934  hypothetical protein  28.38 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3018  hypothetical protein  25.95 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.755001  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3297  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4939  hypothetical protein  32.21 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1061  hypothetical protein  34.56 
 
 		 464 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318763  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4763  hypothetical protein  30.2 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207751  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1599  hypothetical protein  30.22 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4887  hypothetical protein  29.05 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3890  hypothetical protein  26.24 
 
 		 173 aa  48.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.448345  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2690  hypothetical protein  31.11 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>