28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6270 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6270  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  350  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.481188  normal  0.278724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1774  hypothetical protein  89.47 
 
 
171 aa  309  9e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4855  hypothetical protein  45.98 
 
 
189 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457667  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1808  hypothetical protein  45.66 
 
 
179 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0352824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3242  hypothetical protein  47.09 
 
 
177 aa  140  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0369  hypothetical protein  45.71 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0708  hypothetical protein  47.86 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0143  hypothetical protein  47.18 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0012  hypothetical protein  44.6 
 
 
159 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1088  hypothetical protein  38.56 
 
 
160 aa  107  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6286  hypothetical protein  43.04 
 
 
168 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1233  hypothetical protein  41.4 
 
 
178 aa  104  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1123  hypothetical protein  40.76 
 
 
178 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2040  hypothetical protein  35.93 
 
 
163 aa  85.5  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2934  hypothetical protein  32.54 
 
 
166 aa  79  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5311  hypothetical protein  30.91 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0938  hypothetical protein  31.01 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3018  hypothetical protein  27.17 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.755001  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2935  hypothetical protein  38.46 
 
 
164 aa  57.8  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331517  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2690  hypothetical protein  28.9 
 
 
158 aa  55.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0266  hypothetical protein  31.25 
 
 
146 aa  51.2  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.431881  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3297  hypothetical protein  33.64 
 
 
168 aa  51.2  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4763  hypothetical protein  29.41 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207751  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1958  hypothetical protein  29.08 
 
 
155 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.198814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4887  hypothetical protein  25.64 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4939  hypothetical protein  27.59 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000135969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1061  hypothetical protein  33.06 
 
 
464 aa  41.6  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318763  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1599  hypothetical protein  27.52 
 
 
139 aa  41.6  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.258269 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>