25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2934 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2934  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  342  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3018  hypothetical protein  44.3 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.755001  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5311  hypothetical protein  37.2 
 
 
175 aa  123  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558577 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3297  hypothetical protein  34.97 
 
 
168 aa  103  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1774  hypothetical protein  31.55 
 
 
171 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3242  hypothetical protein  30.3 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0708  hypothetical protein  28.1 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4855  hypothetical protein  28.82 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457667  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0143  hypothetical protein  28.76 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2040  hypothetical protein  32.72 
 
 
163 aa  79  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6270  hypothetical protein  32.54 
 
 
171 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.481188  normal  0.278724 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1808  hypothetical protein  34.15 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0352824 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2690  hypothetical protein  30.53 
 
 
158 aa  72  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6286  hypothetical protein  29.81 
 
 
168 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1088  hypothetical protein  29.69 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0369  hypothetical protein  32.03 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0012  hypothetical protein  28.38 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2935  hypothetical protein  30.88 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331517  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1123  hypothetical protein  25.62 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1233  hypothetical protein  29.31 
 
 
178 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4939  hypothetical protein  31.39 
 
 
156 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000135969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4763  hypothetical protein  27.91 
 
 
155 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207751  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0938  hypothetical protein  31.45 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4887  hypothetical protein  28.24 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1061  hypothetical protein  28 
 
 
464 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318763  normal  0.944847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>