28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6286 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6286  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  332  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1233  hypothetical protein  76.92 
 
 
178 aa  235  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1123  hypothetical protein  75.64 
 
 
178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1088  hypothetical protein  50.64 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1808  hypothetical protein  49.38 
 
 
179 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0352824 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4855  hypothetical protein  47.2 
 
 
189 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457667  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3242  hypothetical protein  48.08 
 
 
177 aa  121  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0369  hypothetical protein  42.86 
 
 
156 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6270  hypothetical protein  43.04 
 
 
171 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.481188  normal  0.278724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1774  hypothetical protein  41.03 
 
 
171 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0143  hypothetical protein  42.28 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0012  hypothetical protein  41.5 
 
 
159 aa  90.9  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0708  hypothetical protein  41.1 
 
 
157 aa  87.8  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2040  hypothetical protein  35.9 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0938  hypothetical protein  32.28 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2934  hypothetical protein  29.81 
 
 
166 aa  72  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3018  hypothetical protein  29.34 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.755001  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5311  hypothetical protein  30.54 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2935  hypothetical protein  36.44 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331517  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3297  hypothetical protein  32.91 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2690  hypothetical protein  37.61 
 
 
158 aa  58.9  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4939  hypothetical protein  33.86 
 
 
156 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000135969 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0266  hypothetical protein  34.67 
 
 
146 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.431881  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1061  hypothetical protein  35.71 
 
 
464 aa  54.7  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318763  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4763  hypothetical protein  32.79 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207751  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1599  hypothetical protein  32.23 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4887  hypothetical protein  31.2 
 
 
152 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3890  hypothetical protein  23.91 
 
 
173 aa  42.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.448345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>