44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5202 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5202  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  532  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28697  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4209  hypothetical protein  35.12 
 
 
257 aa  142  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0992  hypothetical protein  34.04 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3311  hypothetical protein  31.45 
 
 
256 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02585  hypothetical protein  35.8 
 
 
269 aa  125  9e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4215  hypothetical protein  34.08 
 
 
263 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0915  hypothetical protein  31.34 
 
 
262 aa  122  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.187168  hitchhiker  1.25009e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2533  hypothetical protein  31.73 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2806  hypothetical protein  31.45 
 
 
256 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.60681  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5396  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629319  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5307  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5686  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5830  hypothetical protein  31.82 
 
 
265 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4628  hypothetical protein  30.8 
 
 
259 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0984  conserved hypothetical protein, membrane  31.92 
 
 
261 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.877759  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1424  hypothetical protein  28.1 
 
 
313 aa  98.2  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0432206  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5493  hypothetical protein  28.97 
 
 
267 aa  89  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0264977 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1437  putative integral membrane protein  28.51 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0261  hypothetical protein  27.52 
 
 
277 aa  77  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0207  hypothetical protein  46.25 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5204  hypothetical protein  30.36 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1694  hypothetical protein  27.98 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163071 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09970  hypothetical protein  27.59 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.887805  normal  0.308407 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05100  hypothetical protein  31.98 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0496  hypothetical protein  27.9 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44296  predicted protein  29.52 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335697  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0744  hypothetical protein  27.51 
 
 
265 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2231  hypothetical protein  26.34 
 
 
279 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.397252  normal  0.947267 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1741  hypothetical protein  27.32 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196782  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02730  hypothetical protein  27.72 
 
 
310 aa  56.2  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26400  hypothetical protein  27.21 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.597608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4551  hypothetical protein  29.89 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32960  predicted protein  26.24 
 
 
256 aa  49.7  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.219119 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42787  predicted protein  27.91 
 
 
309 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0920905  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46392  predicted protein  29.23 
 
 
436 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0897  hypothetical protein  29.38 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.864884  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0886  hypothetical protein  29.38 
 
 
262 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0880  hypothetical protein  29.38 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2859  TspO/MBR family protein  34.38 
 
 
171 aa  43.5  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5100  TspO and MBR like protein  35.78 
 
 
172 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.219885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3085  TspO and MBR like protein  34.38 
 
 
171 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424495  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3295  putative integral membrane protein  32 
 
 
330 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.179488  decreased coverage  0.00096704 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04450  hypothetical protein  24.39 
 
 
301 aa  42.7  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0454  hypothetical protein  24.76 
 
 
273 aa  42.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0585029  normal  0.661293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>