34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0207 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0207  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  462  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1741  hypothetical protein  42.05 
 
 
260 aa  92.4  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196782  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5202  hypothetical protein  30.42 
 
 
269 aa  86.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28697  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26400  hypothetical protein  40.61 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.597608 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1694  hypothetical protein  36.87 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163071 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4215  hypothetical protein  27.84 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4628  hypothetical protein  27.73 
 
 
259 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3311  hypothetical protein  27.83 
 
 
256 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4551  hypothetical protein  41.51 
 
 
276 aa  62.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1437  putative integral membrane protein  34.27 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02585  hypothetical protein  25.68 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2533  hypothetical protein  25.89 
 
 
260 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4209  hypothetical protein  31.18 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0984  conserved hypothetical protein, membrane  26.81 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.877759  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4793  hypothetical protein  44.38 
 
 
272 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0454  hypothetical protein  34.5 
 
 
273 aa  57  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0585029  normal  0.661293 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5396  hypothetical protein  28.5 
 
 
278 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629319  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5686  hypothetical protein  28.99 
 
 
278 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5307  hypothetical protein  28.5 
 
 
278 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5493  hypothetical protein  26.05 
 
 
267 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0264977 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2806  hypothetical protein  32.63 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.60681  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0992  hypothetical protein  30.09 
 
 
265 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09970  hypothetical protein  38.3 
 
 
267 aa  53.5  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.887805  normal  0.308407 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05100  hypothetical protein  37.5 
 
 
259 aa  52.8  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02730  hypothetical protein  34.2 
 
 
310 aa  52.4  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0261  hypothetical protein  29.43 
 
 
277 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5204  hypothetical protein  34.78 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0915  hypothetical protein  47.5 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.187168  hitchhiker  1.25009e-16 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5830  hypothetical protein  40.38 
 
 
265 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44296  predicted protein  44.19 
 
 
289 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335697  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0886  hypothetical protein  31.58 
 
 
262 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3295  putative integral membrane protein  42.11 
 
 
330 aa  42  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.179488  decreased coverage  0.00096704 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0897  hypothetical protein  32.72 
 
 
262 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.864884  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0880  hypothetical protein  32.72 
 
 
262 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>